基于RNA-Seq技術篩選的功能性融合轉錄本TSNAX-DISC1與子宮內膜癌發(fā)生發(fā)展的關聯(lián)研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、作為一種特殊的個體突變,融合基因是由兩個相鄰基因的全部或一部分序列相互融合,通過基因間剪接從而形成的一種新的轉錄物。越來越多的研究表明,融合基因與多種腫瘤的形成和發(fā)展密切相關,但是與子宮內膜癌的相關性研究還尚未報道。
  本研究采用Ilumina HiSequence2000測序平臺對9對子宮內膜癌和癌旁組織進行100bp雙末端轉錄本測序檢測差異表達的融合基因。結果發(fā)現(xiàn)位于子宮內膜癌易感區(qū)域1q42.2內的融合轉錄本TSNAX-D

2、ISC1在子宮內膜癌和癌旁組織中存在顯著的表達差異,該融合轉錄本在多數(shù)癌組織中的表達水平顯著上調。利用逆轉錄聚合酶鏈反應(reverse transcription PCR,RT-PCR)的方法,我們發(fā)現(xiàn)融合轉錄本TSNAX-DISC1并非通過染色體重排的方式形成,而是由相鄰基因TSNAX和DISC1的基因間剪接導致的。進一步的數(shù)據(jù)分析顯示,CCCTC-結合因子(CTCF)在TSNAX和DISC1基因間的絕緣子元件上的結合強度與該融合轉

3、錄本的表達水平呈負相關。位于TSNAX和DISC1基因間的長鏈非編碼RNA lincRNA-NR_034037,通過干擾絕緣子與CTCF的相互作用調控融合轉錄本TSNAX-DISC1的形成以及TSNAX/DISC1的表達水平。另外,熒光素酶報告基因以及染色質免疫共沉淀(ChIP)實驗結果顯示,異常表達的TSNAX可顯著抑制TRAX、Translin和SF-1三者形成的蛋白復合體在類固醇激素合成急性調控蛋白(StAR)基因啟動子上的募集,

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