NaHCO-,3-脅迫下剛毛檉柳基因表達譜的建立及相關基因的克隆.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、剛毛檉柳(Tamarix hispid)為灌木或小喬木,具有強的抗旱、耐鹽、耐水濕、抗沙埋能力,是優(yōu)良的防風固沙、水土保持和鹽堿地造林樹種。而且能在含鹽量1%的鹽堿地上形成自然林,為鹽堿土指示植物,是進行植物抗鹽堿研究的理想材料。本文研究了剛毛檉柳在鹽堿脅迫后不同時間點基因的表達,并克隆出抗逆相關基因。 剛毛檉柳在0.4 mol/LNaHCO<,3>脅迫下,分別處理0h(對照)、24 h和52h,以葉片為材料,分別構建了3個全長

2、cDNA文庫。文庫的滴度分別為7.5×10<'5>pfu、2.6×10<'6>pfu、4.0×10<'6>pfu,插入片段平均長度分別為1.1、1.2和1.2 kb,平均重組率為97.5%。 共獲得9447條高質量的ESTs序列,其登錄號為EH048198-EH057644。它們代表了3945條單一基因序列(Unigene),包括986個contigs和2959個singlets。3個文庫具有的Unigene分別是1752、15

3、58和1675。將9447條EST序列與GenBank的Nr數(shù)據庫進行Blastx和Blastn分析,其qb7365條ESTs(占77.96%)與已知基因序列相似性高(E-value<10<'-4>),其余2082(22.04%)條相似性低或沒有相似性。與已知基因序列相似性高的7365條序列按功能分為12類,其中光合(photosynthesis)占20.31%,功能未知(functionunknown)占13.97%、細胞防御(Cel

4、l rescue,defense)占13.96%、能量(Energy)占7.59%、蛋白質合成(Protein synthesis)占7.58%、轉運(Transport facilitation)占7.28%、轉錄(Transcription)占6.63%、細胞結構(Cell structure)占6.07%、代謝(Metabolism)占5.70%、蛋白質定位(Protein destination)占5.02%、信號轉導(Sign

5、altransduction)占3.86%、細胞生長/分裂(Cell growth,division)占2.04%。 通過對3個cDNA文庫分別進行EST分析和比較建立了NaHCO<,3>脅迫不同時間點的檉柳基因表達譜,鑒定了大量的鹽堿脅迫響應基因。這些基因按功能可以分為:滲透調節(jié)、激素信號轉導、活性氧清除、轉錄調控、蛋白合成和定位、離子平衡、核糖體蛋白、光合作用和代謝等。提示這些途徑都可能參與了剛毛檉柳的耐鹽堿脅迫。

6、在文庫中選擇了9個表達明顯差異的基因,利用實時定量(real time)RT-PCR技術,研究比較了這些基因在NaCl和NaHCO<,3>脅迫下基因表達模式,發(fā)現(xiàn)在NaCl或NaHCO<,3>脅迫24 h后這些基因表達趨勢比較相似。但在脅迫52 h后,這些基因對NaCl和NaHCO<,3>脅迫響應表達趨勢出現(xiàn)明顯差異。 文庫中含有較多的抗逆相關全長基因,從中選擇了液泡膜H<'+>-ATPase C、c″亞基和2個GRP(glyc

7、ine-rich RNA-binding protein)基因,對它們在NaHCO<,3>和NaCl脅迫下基因的表達進一步的分析。NaCI脅迫后 ThVHA cl和 Th VHA c″1,表達量明顯增加,ThGRP1和ThGRP2基因表達量下降;NaHCO<,3>脅迫后 Th VHA cl 和 ThVHA C″1的表達量在24 h下降,52 h上升,而ThGRP1和ThGRP2為24 h上升,52 h下降。 本研究發(fā)現(xiàn)剛毛檉柳對

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