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文檔簡介
1、簾蛤科(Veneridae)是種類最豐富的海產(chǎn)雙殼類動物之一,其中某些種類因種群數(shù)量巨大而成為重要的經(jīng)濟貝類,但國內外學者們對簾蛤科高級階元間的系統(tǒng)發(fā)育關系等問題存在不同見解。此外,該科中的青蛤(Cyclina sinensjs)是我國近幾年崛起的一種新型養(yǎng)殖蛤類,但目前國內外對于青蛤的研究僅限于結構解剖、區(qū)系分布、生活習性等傳統(tǒng)貝類養(yǎng)殖學的內容,缺乏與現(xiàn)代養(yǎng)殖業(yè)密切相關的遺傳多樣性和遺傳結構方面的分析報道。 本研究首次利用分子
2、系統(tǒng)學方法對分布于我國海域簾蛤科貝類10個亞科代表種(共計17個屬20個種)的16SrRNA基因片段分析,同時結合ITSl序列及COI基因對該科中爭議較大的文蛤屬、蛤仔屬的貝類種間關系進行了研究,為簾蛤科的系統(tǒng)發(fā)育和分類提供了有價值的實驗數(shù)據(jù)。此外,還首次利用RAPD及測序分析技術對分布于我國海區(qū)代表性的青蛤種群進行了遺傳多樣性與分化問題的探討。論文內容包括以下五個部分; 第一部分簡要概述了我國海產(chǎn)貝類養(yǎng)殖現(xiàn)狀及面臨的各種問題,
3、敘述了遺傳多樣性及分子系統(tǒng)學研究的歷史及方法的沿革,總結了簾蛤科動物分類和系統(tǒng)發(fā)育研究歷史和現(xiàn)狀。該章節(jié)還重點介紹了本研究中涉及到的目的序列(16S rRNA、COI、ITS)及分析方法(NJ、ML、AMOVA)。 第二部分通過對貝殼外部性狀的測量,使用SAS軟件中的相關與回歸、種群內及種群間的方差檢驗(ANOVA)等程序,分析了我國青蛤9個代表性種群的殼高、殼寬、殼重、軟體部重量等遺傳性狀的特點。結果表明青蛤的殼高與生產(chǎn)性指標
4、一軟體部重量呈明顯的正相關性,而其他性狀與軟體部重量沒有直接的相關性;并通過卡方檢驗證實了莊啟謙(2001)提出的我國青蛤南北海域在殼色和殼緣色的差別。還利用組間平均數(shù)的多重比較一新復極差法分析方法對青蛤不同種群的主要經(jīng)濟性狀進行了詳細的分析,初步結果顯示位于我國江蘇啟東的青蛤種群多項生產(chǎn)性指標優(yōu)良,而位于山東萊州、青島及河北北戴河種群的生產(chǎn)性指標偏低。 第三部分利用RAPD技術對分布于我國遼寧莊河、河北北戴河、浙江黃巖及廣東惠
5、東四個青蛤野生種群的遺傳多樣性及其分化進行了初步探索。實驗用22個10堿基引物從這四個種群分別擴增出179、168、178和181條譜帶。單個引物擴增的RAPD標記在6-12個之間,平均每個引物出現(xiàn)8.2個標記,全部擴增片段長度在310b-2850bp之間。根據(jù)擴增結果計算出四個種群中多態(tài)位點比例分別達到76.92%、75.62%、75.50%和 81.31%;平均雜合度依次為0.2815、0.2794、0.2908和0.3012,遼寧
6、莊河種群與河北北戴河種群間的遺傳距離最小,為0.0657,廣東惠東種群與上述三個種群的遺傳距離在0.0974到0.1032之間,近交系數(shù)(Fst)值在0.1476到0.1997之間,分化Nem值達到1.4437到1.0018之間,說明該種群與其他種群間產(chǎn)生了較明顯的遺傳分化。 第四部分通過對我國四大海區(qū)青蛤9個代表性種群的45個個體18S與5.8SrDNA之間轉錄間隔區(qū)(ITSl)564bp到595bp之間的序列分析,比對結果表
7、明,不計插入/缺失部分共有68個多態(tài)性位點,核酸平均多態(tài)性指數(shù)Pi=0.0312,平均每位點Eta=0.0294。在45個個體中共檢測出15種單倍型(Haplotype)基因序列。以單倍型序列為基礎,利用Arlequin軟件中的AMOVA分子方差分析法,對青蛤種群內、種群間及不同組間的遺傳變異進行了等級分析,可將青蛤劃分黃海組,渤海組),東海組,南海組和日本海組。結果顯示,種群內和不同組間(海區(qū))均有較高的遺傳變異,但對總變異的貢獻主要
8、來源于組間(不同海區(qū)間)。 第五部分對簾蛤科10個亞科代表種(17個屬20種)的16S rRNA基因片段進行了PCR擴增和測序測定,使用ClustalX中的多重比對,用PAUP 4.10中的鄰接法(NJ)和最大似然法(ML)分別構建分支樹。遺傳距離矩陣及拓撲結構圖顯示,簾蛤科貝類可分為三個主要分支,美女蛤亞科最早分出,成為單獨的一支,與同科的其他類群分歧時間較早;綴錦蛤亞科、雪蛤亞科和簾蛤亞科構成一個分支,其中雪蛤亞科和簾蛤亞科
9、的關系更為近緣;另一分支由文蛤亞科、仙女蛤亞科、鏡蛤亞科、和平蛤亞科、卵蛤亞科和青蛤亞科組成,其中文蛤亞科、鏡蛤亞科和卵蛤亞科關系近緣、其它亞科間的關系較復雜,未得到明確解析。此外,利用COI、ITSl的序列綜合分析了蛤仔屬的R.bruguieri、R.decussatus、菲律賓蛤仔和雜色蛤仔的種間關系,表明后二者的親緣關系較遠,似應歸入不同的屬。文中討論了文蛤屬的文蛤、麗文蛤、斧文蛤和簾文蛤間的分類及分布問題,結果表明文蛤和麗文蛤的
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