1、堿性螺旋-環(huán)-螺旋(bHLH)結構域是一段高度保守的氨基酸基序，是真核生物中一類能結合DNA的轉錄因子。這些bHLH蛋白在動物、植物與真菌各種發(fā)育過程中起著重要的調控作用，例如在植物中的氣孔與胚胎發(fā)育、動物中的細胞周期調控、性別決定與細胞分化，以及真菌中的糖酵解、麥角固醇與磷脂合成等。由于家犬在種間具有豐富的遺傳與形態(tài)多樣性，因此它在遺傳學、生理學與行為研究中常被當作模式生物來研究。同時它還適用于哺乳動物呼吸與心血管功能的研究。然而至今

2、為止，家犬的bHLH方面的研究卻鮮有報道。
　　bHLH基序是由兩段功能不同的保守結構域組成，合在一起的總長度約為60個氨基酸。bHLH結構域的氨基端是由13個氨基酸殘基組成的能結合DNA的堿性(Basic)區(qū)域。與堿性區(qū)域羧基端相鄰的是螺旋-環(huán)-螺旋(Helix-Loop-Helix)區(qū)域，它包含大約45個氨基酸，主要功能是與其他bHLH蛋白形成二聚體。根據(jù)其進化關系、DNA結合序列以及功能特點，現(xiàn)在動物bHLH轉錄因子被分成了

3、6個高階組以及45個家族。
　　本論文中，我們全面地鑒定了家犬bHLH轉錄因子的家族成員并且系統(tǒng)分析了家犬bHLH的DNA與氨基酸序列的結構特點。我們首先在家犬基因組中成功鑒定出115條bHLH基因，并且根據(jù)系統(tǒng)發(fā)生關系將這115個基因歸入了44個家族與6個高階組中，其中51、26、14、4、12與4個成員被分到了對應的6個不同的高階組（分別用A到F表示）里，剩下的4個基因被歸入“孤兒”基因家族。Delilah家族中沒有發(fā)現(xiàn)任何家

4、犬bHLH基因。此外，基于家犬與其余6種脊椎動物bHLH氨基酸位點的熵值分析表明bHLH結構域在脊椎動物中是非常保守的。從整體上來說，bHLH結構域之外的氨基酸序列，在不同的bHLH蛋白中差別很大。然而一些特殊的結構域通常存在于特定的bHLH高階組中。我們發(fā)現(xiàn)家犬bHLH蛋白中最常見的是PAS/PAC結構域、ORANGE結構域、“WRPW”肽鏈以及亮氨酸拉鏈結構域，并且大部分結構域都位于bHLH基序的羧基端?；趦群拥姆植?、位點以及相