BLU基因在胃癌中的表達及其甲基化調控機制的實驗研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的:腫瘤抑制基因BLU的表觀遺傳學沉默與多種惡性腫瘤的發(fā)生密切相關,然而,BLU在胃癌中的表達及其生物學功能尚無相關報道。本研究旨在初步探討B(tài)LU基因在胃癌中的表達變化及其甲基化調控機制。
  方法:(
  1)用實時定量PCR(qRT-PCR)法檢測52例胃癌組織及對應的癌旁組織、6株胃癌細胞(SGC7901, HGC27, BGC823, MKN45, MGC803,AGS)及胃黏膜正常上皮細胞GES-1中BLU mR

2、NA表達水平,Western blot法檢測7株細胞中BLU蛋白表達水平;
  (2)采用Promoter Scan program軟件預測BLU核心啟動子區(qū),并通過雙熒光素酶報告基因實驗進行驗證,采用TFSEARCH和Methyl Primer Express Software v1.0軟件預測BLU核心啟動子區(qū)中可能有轉錄因子結合的功能性CpG位點;
 ?。?)重亞硫酸鹽測序PCR(BSP)法分析胃癌細胞和組織中BLU核

3、心啟動子區(qū)CpG位點的甲基化程度,初步分析 DNA甲基化和 BLU基因表達的關系,找出潛在的功能性CpG位點;
  (4)去甲基化藥物處理AGS和SGC7901細胞,qRT-PCR和Western blot法分析處理后BLU表達變化;
 ?。?)siRNA干擾Sp1表達及雙熒光報告基因實驗,分析BLU表達是否受轉錄因子Sp1調控;
 ?。?)在AGS和SGC7901細胞中,通過染色質免疫共沉淀(ChIP)方法分析Sp1

4、能否與BLU啟動子區(qū)結合,采用電泳遷移率實驗(EMSA)及雙熒光素酶報告基因實驗分析SGC7901細胞中BLU-39CpG位點甲基化對Sp1結合能力的影響;
 ?。?)通過CCK-8實驗及平板克隆形成實驗,研究BLU表達下調對胃癌細胞SGC7901增殖能力及克隆形成能力的影響。
  結果:
  (1)6株胃癌細胞中 BLU表達水平均顯著低于胃黏膜正常上皮細胞株GES-1,69.2%(36/52)的胃癌組織中BLU mR

5、NA表達明顯低于對應癌旁組織,且胃癌組織臨床病理特征均與 BLU表達之間無顯著相關性;
  (2)BLU基因核心啟動子區(qū)位于-181~+63bp,軟件預測出-85CpG和-39CpG是潛在的功能性CpG位點;
  (3)胃癌細胞和組織中BLU表達水平與其啟動子區(qū)甲基化水平(尤其是-39CpG位點的甲基化)負相關,提示-39CpG是潛在的功能性CpG位點;
  (4)去甲基化藥物處理AGS和SGC7901細胞后,BLU表

6、達出現不同程度的恢復;
 ?。?)BLU轉錄受轉錄因子Sp1的激活;
 ?。?)Sp1結合于BLU近端啟動子區(qū)(-43~35bp),且其結合位點“GC box”中-39CpG位點的甲基化可降低其結合能力,進而阻礙BLU基因的轉錄及表達;(7)通過siRNA干擾BLU的表達之后,SGC7901細胞的增殖能力和平板克隆形成能力顯著提高。
  結論:
 ?。?)BLU基因在胃癌中的失活與其核心啟動子(尤其是-39CpG

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