1、DNA重組激活基因(Recombination activating genes，RAG)是脊椎動物特異性免疫反應的關鍵基因，也是脊椎動物進化分析的標記基因之一。鯽魚具有很強的適應性和抗病能力，是我國廣泛養(yǎng)殖的重要經(jīng)濟淡水魚；由于具有不同的倍性和豐富的遺傳多樣性，又是研究魚類基因組進化的獨特材料。本研究用PCR方法擴增、克隆了鯽魚的Rag基因。鯽魚Rag1基因從起始密碼到終止密碼總長4188bp，由三個外顯子和兩個內含子組成，其中開放閱

2、讀框長3192bp，編碼1063個氨基酸。Rag2基因從起始密碼到終止密碼總長1593bp，沒有內含子，只有單一的編碼區(qū)，編碼530個氨基酸。Rag1和Rag2基因的ORF和氨基酸序列在不同魚類中的對比結果表明其在進化過程中非常保守。不同魚類Rag1基因的第二內含子也是高度保守的，轉錄因子結合位點分析表明在第二內含子的保守區(qū)域中有許多轉錄因子的可能結合位點。其中有一段在所有已知魚類中都存在的保守區(qū)域是與性腺發(fā)育相關的轉錄因子SRY和SO

3、X5的可能結合位點，提示Rag1基因的表達可能與性腺發(fā)育具有相關性。用RT-PCR方法進行的組織特異性表達分析表明Rag1基因在鯽魚成體的頭腎和精巢都能檢測到表達，提示Rag基因不僅主導了免疫組織中的DNA重組，也可能參與了生殖細胞的DNA重組。RT-PCR檢測證明Rag1基因在鯽魚胚胎發(fā)育至第5天開始表達，在第7天鯽魚胚胎的胸腺原基中可檢測到Rag1基因mRNA的雜交信號，在第9天鯽魚胚胎的胸腺原基中可以檢測到很強的Rag1 mRNA