1、生物信息學(xué)是一門(mén)新興的交叉學(xué)科，它是伴隨著基因組研究產(chǎn)生的，主要是研究分子生物學(xué)與基因和蛋白質(zhì)序列有關(guān)的復(fù)雜計(jì)算問(wèn)題。廣義地說(shuō)，生物信息學(xué)從事對(duì)基因組研究相關(guān)生物信息的獲取、加工、儲(chǔ)存、分配、分析和解釋。這一定義包括了兩層含義，一是對(duì)海量數(shù)據(jù)的收集、整理與服務(wù)，也就是管好這些數(shù)據(jù)；另一個(gè)是從中發(fā)現(xiàn)新的規(guī)律，也就是用好這些數(shù)據(jù)。 在生物信息學(xué)中，序列比對(duì)是最重要的原始操作，是許多其它更復(fù)雜操作的基礎(chǔ)。目前應(yīng)用罰分函數(shù)來(lái)做為生物序列

2、比對(duì)標(biāo)準(zhǔn)的方法已經(jīng)比較成熟，但該方法忽略了組成基的化學(xué)性質(zhì)和化學(xué)結(jié)構(gòu)，并且存在選取罰分函數(shù)的隨意性，而選取罰分函數(shù)的好壞直接影響相似性分值，尤其對(duì)于RNA而言，該方法不適用于帶假結(jié)以及較大的RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)相似性比較。 近二十年來(lái)，生物序列的圖形表示方法在研究生物序列局部和整體的比對(duì)分析中起的作用越來(lái)越大，并且與之相對(duì)應(yīng)的數(shù)值特征及相似性分析使這些直觀的視覺(jué)感知更加理性化。本文針對(duì)DNA序列和RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)序列提出了新的圖形表示方

3、法，及闡述了其在序列相似性比對(duì)上的應(yīng)用。本文的創(chuàng)新點(diǎn)主要有： 在第二章，我們提出了DNA的一種基于4條特征曲線的新的二維圖形表示方法。對(duì)于這種新的圖形表示方法，本文給出了求其數(shù)值特征向量的方法，并運(yùn)用特征向量對(duì)11種生物的β-globin基因的第一外顯子序列進(jìn)行了相似性分析。由于二維表示方法自身存在著一些不足，我們又將其改進(jìn)，給出改進(jìn)后的新的DNA序列八維圖形表示方法，構(gòu)造了新的特征向量來(lái)進(jìn)行生物DNA序列的相似性比對(duì)研究。