土拉弗朗西斯氏菌、炭疽芽孢桿菌定量PCR檢測技術(shù)的研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的:土拉弗朗西斯氏菌(Francisella tularensis, FT)和炭疽芽孢桿菌(Bacillusanthracis, BA)具有高致病性,是重要的生物戰(zhàn)劑和生物恐怖劑,給人類的健康構(gòu)成了嚴重威脅,因此有必要建立一種快速、可靠的檢測這兩種細菌的方法。
   方法:本研究基于TaqMan熒光探針定量PCR技術(shù),建立并優(yōu)化定量PCR檢測體系,針對特異的染色體序列Aldo/keto reductase醇醛酮還原酶基因(AK

2、R基因)和外膜蛋白基因(fopA)設(shè)計引物及探針,檢測土拉弗朗西斯氏菌;針對位于兩個毒力相關(guān)質(zhì)粒上的莢膜因子(capA)和致死因子基因(lef)以及染色體上的特異序列(GS)設(shè)計多對引物及探針,聯(lián)合檢測炭疽芽孢桿菌。選擇基因組同源性高的菌種DNA作為模板,評價該檢測體系的特異性;采用克隆株或減毒株以及強毒株基因組DNA作為模板,評價該檢測體系的靈敏度。利用克隆株或減毒株污染環(huán)境土壤制備模擬樣品,評價該檢測體系在快速檢測與現(xiàn)場檢測等實際應(yīng)

3、用中的表現(xiàn)。分別采用重組質(zhì)粒、克隆株或減毒株以及模擬污染水樣本為模板,在上海消防特勤支隊的進口消防多功能偵檢車上,與進口熒光定量PCR試劑進行平行比對檢測試驗,評價該檢測體系的準(zhǔn)確率與檢出率。
   結(jié)果:(1)優(yōu)化篩選出土拉弗朗西斯氏菌染色體上的FT-AKR和FT-fopA片段作為檢測靶序列,建立了TaqMan熒光定量PCR快速檢測鑒定土拉弗朗西斯氏菌的反應(yīng)體系及條件,以其他非土拉弗朗西斯氏菌菌種為模板未出現(xiàn)非特異擴增;檢測克

4、隆株質(zhì)粒的靈敏度均為每個反應(yīng)體系10拷貝;以土拉弗朗西斯氏菌基因組DNA作為模板的靈敏度試驗,AKR-F/R引物對檢測靈敏度可以達到0.25pg/μl; fopA-F/R引物對檢測靈敏度是2.5pg/μl;用克隆株模擬環(huán)境土壤樣本,兩個引物對的檢測靈敏度分別為440和960CFU/g土壤;盲測實驗結(jié)果顯示對于靈敏度范圍內(nèi)的陽性樣本均能正確識別,并且能夠正確檢測出不同濃度的陽性樣本。本檢測體系與進口熒光定量PCR試劑對比檢測試驗結(jié)果顯示:

5、4份不同濃度的陽性樣本與2份陰性樣本均能正確識別;模擬6份污染水樣本檢出率100%,進口試劑陽性漏檢1份。(2)優(yōu)化篩選出炭疽芽孢桿菌基因組特異序列GS序列和pXOl質(zhì)粒的lef基因、pX02質(zhì)粒的capA基因作為檢測靶序列,建立了TaqMan熒光定量PCR快速檢測鑒定炭疽芽孢桿菌的反應(yīng)體系及條件,以其他非炭疽芽孢桿菌菌種為模板未出現(xiàn)非特異擴增;以BA-lef.BA-capA和BA-GS克隆株提取的質(zhì)粒DNA作為模板,capA-F/R和

6、GS-F/R引物對檢測靈敏度為每個反應(yīng)體系10拷貝,lef-FIR引物對為每個反應(yīng)體系102拷貝;以炭疽芽孢桿菌Sterne菌株作為模板,lef-F/R和GS-F/R引物對檢測靈敏度為1.2xl0-2 CFU/μl:以炭疽芽孢桿菌基因組DNA作為模板,lef-F/R引物對檢測靈敏度可以達到2.4fg/μl;CapA-F/R引物對檢測靈敏度是24fg/μl: GS-F/R引物對檢測靈敏度是0.24pg/μl:用炭疽芽孢桿菌Sterne菌株

7、芽孢模擬環(huán)境土壤樣本,lefF/R和GS-F/R引物對的檢測靈敏度可達2x103 CFU/g土壤;盲測實驗結(jié)果顯示對于靈敏度范圍內(nèi)的陽性樣本均能正確識別,并且能夠正確檢測出不同濃度的陽性樣本。本檢測體系與進口熒光定量PCR試劑對比檢測試驗結(jié)果顯示:4份不同濃度的陽性樣本與2份陰性樣本均能正確識別;模擬6份污染水樣本檢出率100%,與進口試劑檢出率持平。
   結(jié)論:本研究建立的土拉弗朗西斯氏菌和炭疽芽孢桿菌的檢測鑒定體系,方法簡

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