變形假單胞菌2-酮基葡萄糖酸代謝調控蛋白PtxS的克隆表達、分離純化及鑒定.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、2-酮基葡萄糖酸(2-ketogluconic acid,2KGA)是一種重要的有機酸,也是生產(chǎn)食品抗氧化劑異抗壞血酸的前體物質。本論文旨在從國內2KGA生產(chǎn)的主要工業(yè)用菌——變形假單胞菌(Pseudomonas plecoglossicida)JUIM01中克隆發(fā)酵目的產(chǎn)物代謝調控蛋白PtxS的基因,并對該基因進行表達以及表達產(chǎn)物的分離純化。在此基礎上,利用生物信息學分析、基因敲除、聚丙烯酰氨凝膠電泳、基質輔助激光解吸電離飛行時間質譜

2、、圓二色光譜儀、動態(tài)光散射以及等溫滴定量熱等技術,對PtxS蛋白的結構與功能進行初步的研究,進而為后續(xù)的2KGA高效生產(chǎn)菌株的構建提供一定的理論依據(jù)。
  主要研究結果如下:
  (1)采用TD-PCR技術首次從變形假單胞菌JUIM01中克隆了ptxS基因,其核苷酸序列全長為1023 bp,編碼由340個氨基酸殘基組成的蛋白PtxS。生物信息學的分析結果表明:變形假單胞菌JUIM01的PtxS蛋白與NCBI數(shù)據(jù)庫中Ps. p

3、utida、Ps. mosselii和Ps. plecoglossicida的PtxS蛋白在氨基酸序列上具有較高的一致性,分別達到88%、84%和74%;該PtxS蛋白的DNA結合結構域位于氨基酸序列的N末端,包含螺旋-轉角-螺旋基序;該PtxS蛋白的理論分子質量為36651.7 u,理論等電點為6.39;該PtxS蛋白定位于細胞質,無信號肽和跨膜區(qū),為親水性蛋白;該PtxS蛋白中有7個豆蔻酰化位點、3個酪蛋白激酶II磷酸化位點、2個蛋

4、白激酶C磷酸化位點和1個LacI-type HTH結構域;該PtxS蛋白中存在α螺旋(alpha helix)、延伸鏈(extended strand)、β轉角(beta turn)和無規(guī)卷曲(random coil)4種結構形式,各自所占的比例分別為54.41%、13.53%、10.88%和21.18%;該PtxS蛋白與參與2KGA分解代謝的一些蛋白質具有臨近關系,且同時存在于細胞中。
 ?。?)通過對克隆的ptxS基因以及質粒

5、pET-28a進行雙酶切、連接等操作,構建了重組質粒pET-28a-ptxS,在此基礎上構建了重組菌株E. coli BL21(DE3)/pET-28a-ptxS。聚丙烯酰氨凝膠電泳分析結果表明,ptxS基因在E. coli BL21(DE3)中得到了成功表達,表達產(chǎn)物的分子質量為36.7 ku,與采用生物信息學方法預測的PtxS蛋白的分子質量相符。對重組菌株的菌體細胞進行超聲破碎,然后通過離心分離、凍融沉淀等方法去除部分雜蛋白,再利用

6、親和層析以及凝膠過濾層析進行分離純化,得到了純化的PtxS蛋白。圓二色光譜分析結果表明,PtxS蛋白中α螺旋,延伸鏈,β轉角和無規(guī)則卷曲所占比例分別為52.3%、11.5%、14.3%和22.0%,與使用SOPMA工具預測的結果相似。動態(tài)光散射分析結果表明,純化的PtxS蛋白在溶液中以單體形式存在,其粒徑、分子質量和多分散指數(shù)(polydispersity, Pd)分別為2.554530 nm、30 ku和23.2%。
 ?。?)

7、基于生物信息學分析結果,采用重疊PCR(overlap PCR)技術克隆了ptxS基因的缺失片段,在此基礎上構建了ptxS基因的敲除菌株Ps. plecoglossicida JUIM01ΔptxS。通過比較菌株JUIM01ΔptxS與菌株JUIM01的2KGA發(fā)酵過程可以發(fā)現(xiàn),PtxS蛋白可以阻遏2KGA的分解代謝。等溫滴定量熱(isothermal titration calorimetry,ITC)分析結果表明,在體外2KGA可以

8、特異性地結合PtxS蛋白;與2KGA的結合可以導致PtxS蛋白二級結構的明顯改變。因此,可以認為2KGA是PtxS蛋白的效應物分子。從課題組克隆的2KGA利用操縱子即kgu操縱子(2-ketogluconate utilization operon, kgu operon)中,檢索到位于其5'端的14 bp的反向重復序列(5'-TGAAACCGGTTTCA-3')。ITC分析結果表明,純化的PtxS蛋白在體外可以與反向重復序列(5'-T

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