1、脫氧核苷酸 DNA(Deoxyribonucleic acid)分子的雙螺旋結構的發(fā)現(xiàn)標志著生物學從傳統(tǒng)生物學到分子生物學的跨越。從二十世紀七十年代Sanger測序技術的誕生開始，研究人員開始逐步研究生物系統(tǒng)中基因序列-蛋白質-生化反應的生物信息流的走向，并從中挖掘出基因序列中蘊含的分子結構的特性、生物網(wǎng)絡狀態(tài)等信息。
　　本文在前人工作的基礎上，從轉錄組的序列的信息出發(fā)，找到序列中包含的酶的信息,并基本形成了從二代測序數(shù)據(jù)到代謝

2、網(wǎng)絡酶的信息注釋工具，并基本完成了從基因序列到代謝網(wǎng)絡的分析過程，其中包括整合的二代測序數(shù)據(jù)分析工具、酶序列信息數(shù)據(jù)庫以及代謝網(wǎng)絡比對等。本文將常用的二代測序數(shù)據(jù)分析工具整合在Java桌面應用程序下，方便生物學家對序列數(shù)據(jù)進行處理；同時利用計算機的爬蟲技術收集和整理美國生物技術信息中心NCBI（US National Center for Biotechnology Information）的DNA序列數(shù)據(jù)庫、日本京都基因與基因組數(shù)據(jù)庫

3、KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)中酶的信息，構建了本地化的酶序列數(shù)據(jù)庫；通過上述酶的序列信息快速的構建了代謝網(wǎng)絡模型，并完成代謝網(wǎng)絡比對算法的設計。最后，本文對比研究了基于酶的序列和酶的編碼值對代謝網(wǎng)絡的比對結果的影響，發(fā)現(xiàn)酶序列信息得到的結果更能夠反映物種之間的進化關系。本研究拓展了二代測序數(shù)據(jù)的應用，方便了生物學者對代謝網(wǎng)絡中酶的研究，提供了從多角度對代謝網(wǎng)絡比對的分析，對于