豬流行性腹瀉病毒流行毒株的分離、鑒定及致病性研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、豬流行性腹瀉(porcine epidemic drarrhea,PED)是由豬流行性腹瀉病毒(porcine epidemicdiarrhea virus,PEDV)引起的一種以腹瀉、嘔吐、脫水和對哺乳仔豬高致死率為主要特征的急性、高度接觸性的豬腸道傳染病。PEDV可以感染各年齡段的豬,但哺乳仔豬更易感染,其死亡率和發(fā)病率接近100%。1971年該病首次在英國彼發(fā)現(xiàn),隨后蔓延至歐洲及亞洲部分國家。2013年美國首次報道了PEDV感染,

2、而后該病迅速蔓延至全國,造成了嚴重經濟損失,從而使得PEDV受到世界各國的關注。我國2010年就曾爆發(fā)過嚴重的PED疫情。近年來,PED的流行更是越來越廣泛,新的變異株不斷出現(xiàn),商品化疫苗與流行毒株的抗原性不匹配,免疫效果不佳,從而嚴重影響著我國養(yǎng)豬業(yè)的健康發(fā)展。鑒于目前對于新的PEDV流行毒株基因組特征及流行病學情況還不十分明確,本研究開展了以下幾方面的工作,旨在為進一步闡明PEDV中國流行毒株的分子特點、致病性以及篩選新的、有效候選

3、疫苗毒株等奠定基礎。
  1、對2016-2017年間我國6個省份(甘肅、新疆、陜西、湖南、海南、河南)的仔豬腹瀉情況進行了流行病學調查,并采集獲得了134份腹瀉糞便樣品。同時,成功建立了PEDV TaqMan探針實時熒光定量RT-PCR方法。經驗證,該方法最低檢測到240copies/μL,并且僅可檢測出PEDV,表明靈敏度和特異性均良好。同時,該方法批間重復和批內重復變異系數均小于1%,表明該萬法重復性好。利用本研究建立的qP

4、CR檢測方法和常規(guī)PCR分別對上述樣品進行了檢測,結果表明,糞便樣品中PEDV和豬嵴病毒(Porcine kobuvirus,PKV)的陽性率分別為54.4%(73/134)和17.2%(23/134),且樣品中未檢測出豬傳染性胃腸炎病毒(Transmissible gastroententis virus,TGEV)以及豬德爾塔冠狀病毒(Porcine deltacoronavirus,PDCoV)。值得注意的是,本研究首次在海南樣品

5、中檢測到PEDV感染的存在,其陽性率為59.5%(25/42)。
  2、從73份PEDV陽性樣品中分離到了11株PEDV流行毒株,對其進行了主要抗原S基因的序列測定,結果表明,這11株毒株,其核苷酸和氨基酸相似性與經典毒株CV777相比分別為93-94%和92-93%,并在S1區(qū)域都出現(xiàn)一處插入(A133)和缺失(G155)以及連續(xù)4個氨基酸的插入(56NNTN59)。上述結果提示2016-2017年中國PEDV流行毒株主要為G

6、2基因型,并且與經典疫苗毒株在主要抗原基因S基因區(qū)域存在較大差異。本結果為了解和掌握2016-2017年我國PEDV的流行情況及基因多樣性豐富了數據。
  3、對上述11株PEDV毒株分別進行體外細胞傳代培養(yǎng),從中成功分離到一株細胞適應毒株CH/HNPJ/2017(GenbankAccession MF152604)。該毒株在P1代就出現(xiàn)典型細胞病變(Cytopathic effect,CPE),隨著培養(yǎng)代數的增加,病毒滴度逐漸增

7、加并穩(wěn)定在107TCID50/mL以上。通過免疫熒光方法可以檢測到呈現(xiàn)綠色熒光的PEDV病毒粒子。電鏡檢測可觀察到直徑約100nm大小的、近似圓形的病毒粒子,四周有S蛋白所形成的冠狀病毒所特有的、典型的花冠狀纖突。利用特異性引物對CH/HNPJ/2017毒株的全基因組序列進行了擴增和測序,系統(tǒng)進化分析結果顯示該毒株位于G2b基因型亞群,與AJ1102和CHGD-01毒株親緣關系較近,而與疫苗株CV777親緣關系相對較遠。特別值得注意的是

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