1、蛋白質(zhì)-多肽間相互作用是計(jì)算生物學(xué)中的熱門方向，對(duì)其結(jié)合的精確預(yù)測(cè)有助于了解體內(nèi)復(fù)雜的信號(hào)通路以及相關(guān)蛋白質(zhì)功能，并對(duì)進(jìn)一步的藥物設(shè)計(jì)有著至關(guān)重要的作用。蛋白質(zhì)-多肽對(duì)接方法能夠有效的模擬蛋白質(zhì)-多肽間相互作用，其對(duì)接算法性能直接決定模擬實(shí)驗(yàn)的成功與否和準(zhǔn)確性，因此，面向蛋白質(zhì)-多肽的對(duì)接算法也就成為當(dāng)前眾多學(xué)者關(guān)注的研究熱點(diǎn)。
　　可將蛋白質(zhì)-多肽對(duì)接問(wèn)題轉(zhuǎn)化為一個(gè)變量?jī)?yōu)化問(wèn)題，其優(yōu)化的目標(biāo)是尋找配體和受體結(jié)合的低能構(gòu)象，而其對(duì)

2、接性能主要取決于快速有效的構(gòu)象搜索算法和精確的能量評(píng)估函數(shù)。為進(jìn)一步提高蛋白質(zhì)-多肽對(duì)接的成功率和準(zhǔn)確性，本文從蛋白質(zhì)-多肽對(duì)接的構(gòu)象搜索算法入手，將群智能算法中的經(jīng)典代表-人工蜂群算法進(jìn)行改進(jìn)，并引入到蛋白質(zhì)-多肽對(duì)接當(dāng)中。
　　針對(duì)人工蜂群算法收斂速度慢，易陷入局部最優(yōu)等問(wèn)題，本文提出了采用面向多較優(yōu)近鄰互學(xué)習(xí)機(jī)制的改進(jìn)蜂群算法EMLABC，進(jìn)一步提高了人工蜂群算法的探索和開(kāi)發(fā)性能。在和ABC算法及其變種以及經(jīng)典PSO算法變種

3、進(jìn)行的對(duì)比測(cè)試中，EMLABC在收斂速度、準(zhǔn)確性和穩(wěn)定性上都有顯著的提升。本文中還將EMLABC算法引入蛋白質(zhì)-多肽對(duì)接問(wèn)題中，作為其構(gòu)象搜索方法，結(jié)合AutoDock4.2能量打分函數(shù)引導(dǎo)構(gòu)象搜索，提出一種新的蛋白質(zhì)-多肽對(duì)接算法EMLABCDock。在同當(dāng)前主流的面向蛋白質(zhì)-多肽的對(duì)接算法進(jìn)行的對(duì)比實(shí)驗(yàn)中，與HADDOCK、DynaDock、pepATTRACT、GalaxyPepDock、pepCrawler和Rosetta Fl