基于圖論的單體型重建算法設計和可視化實驗平臺的構建.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、分析和識別單體型對基因的精確定位、了解基因功能、復雜疾病診斷和藥物研究等有著重要作用。不幸的是，由于當前實驗條件的限制，通過生物學方法直接測定個體單體型所需的時間和金錢花費十分昂貴，利用計算機技術來確定個體單體型具有極其重要的現(xiàn)實意義。單體型組裝問題是利用個體DNA片段測序結果獲取一對完整單體型的問題，目前大部分單體型組裝問題的計算模型都被證明是NP難的，因此設計快速準確的單體型重建算法來解決單體型組裝問題成為生物信息學的一個重要研究方

2、向。
　　我們首先對單體型組裝問題已有的計算模型和重建算法進行了研究，進而通過對重建過程的分析，提出了一種新的算法。該算法根據(jù)SNP位點之間相同或相異的關系把SNP矩陣轉化為位點關聯(lián)圖，通過尋找位點關聯(lián)圖的無沖突著色序列來完成重建過程。實驗表明，我們提出的這個算法擁有良好的性能表現(xiàn)，能夠準確的進行單體型重建。與目前性能優(yōu)秀的另外兩種算法相比，在同等情況下該算法所需的運行時間更短，具有較高的實用價值。
　　一個算法性能的優(yōu)劣要

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