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文檔簡介
1、丙型肝炎是一種流行較為廣泛的病毒性疾病,是一個對社會及經(jīng)濟有重要影響的全球問題。我國HCV感染者約4100萬,流行率已達總?cè)丝诘?.2%。而且,每年有300~400萬新發(fā)病例[1]。丙型肝炎慢性化的發(fā)生機制尚未明確,但有證據(jù)表明,免疫耐受是關(guān)鍵其因素之一[2]。
PD-1在HCV慢性感染患者體內(nèi)表達升高并且與HCV的慢性化密切相關(guān),但其機理尚未得以闡明?;虻霓D(zhuǎn)錄起始是基因表達的第一步,也是受到嚴(yán)格控制的一步,它對了解一個基因
2、的表達水平至關(guān)重要,而且已有許多成熟的方法可以使人們對此進行研究,而啟動子和轉(zhuǎn)錄因子的相互作用是轉(zhuǎn)錄起始階段調(diào)控的重點環(huán)節(jié),故我們決定從PD-1啟動子研究入手來尋找PD-1在慢性感染疾病進程中高表達的原因。
本研究首先獲取PD-1基因的全序列,然后利用生物信息學(xué)在線分析查找PD-1啟動子在該基因全序列中的可能位置。將PD-1啟動子全長克隆到熒光素酶報告基因載體pGL3-basic中,轉(zhuǎn)染Jurkat細胞,利用熒光素酶活性檢測手
3、段確定PD-1啟動子序列的轉(zhuǎn)錄活性。然后根據(jù)PD-1啟動子序列,以3’區(qū)為核心,向5’方向設(shè)計不同長度的截短體。后者分別被克隆入熒光素酶報告基因載體pGL3-basic中,根據(jù)熒光素酶活性檢測結(jié)果,尋找其中能使熒光素酶產(chǎn)生最強活性的截短體,即為PD-1核心啟動子序列。
我們首先從GENEBANK上獲得PD-1基因(GeneID:5133)的全序列,利用生物信息學(xué)手段,找到PD-1基因調(diào)控區(qū)得分最高的七個順式作用元件Mef2、E
4、RE、GATA、TEF、TATA、GATA和ERE。同時經(jīng)過分析確定PD-1mRNA序列第一外顯子上游1500bp及下游150bp共1650bp核苷酸為其啟動子所在區(qū)域。將啟動子全長克隆到熒光報告基因載體pGL3-basic中,通過熒光素酶活性檢測,確定該啟動子具有較強的轉(zhuǎn)錄活性。然后以PD-1基因啟動子3’端為核心,向5’方向設(shè)計七個不同長度的截短體(1650bp、1450bp、1250bp、1128bp、874bp、674bp、47
5、4bp和274bp),并將其分別克隆到熒光報告基因載體pGL3-basic中。熒光素酶活性檢測結(jié)果顯示,pGL3-1128所在細胞的熒光素酶活性最高,說明該截短體的轉(zhuǎn)錄活性最強,故而認(rèn)為PD-1的核心啟動子區(qū)域為-978bp~+150bp(1128bp)。
在此基礎(chǔ)上我們擬進一步確定與PD-1的核心啟動子結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子,并研究這些轉(zhuǎn)錄因子與HCV感染慢性化的關(guān)系。該研究對于闡明HCV慢性化的機理具有重要意義,同時也可能為臨床上
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