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文檔簡介
1、目的:研究并行計算集群的構建策略和實現(xiàn)方法,生物信息學并行軟件的配置和安裝以及在生物信息學方面的應用。并且探討并行計算集群的性能,在加快生物信息學研究方面的意義。 結論:我們已經(jīng)實現(xiàn)并行生物計算集群的構建,其計算性能達到了超線性加速。該生物計算集群可以在局域網(wǎng)范圍內(nèi)實現(xiàn)計算任務提交,對本實驗室的生物學研究具有巨大的推動作用。 課題二腫瘤轉移相關基因的基因組聚類和功能注釋及新的腫瘤轉移相關基因的高通量虛擬篩選 研究
2、背景及目的:研究目前所有已知腫瘤轉移相關基因的功能聚類及注釋,研究人類基因組上腫瘤轉移相關基因的編碼熱區(qū)及功能組成。并以已知的腫瘤轉移相關基因核酸序列為基礎,利用并行生物計算平臺,從人類EST數(shù)據(jù)庫挖掘新的腫瘤轉移相關基因。以期發(fā)現(xiàn)基因功能與基因組定位間的內(nèi)在聯(lián)系,進一步闡明腫瘤轉移的分子機理和尋找更多的腫瘤轉移阻斷靶點。 結論:采用生物信息學方法成功鑒定了腫瘤轉移相關基因的基因組編碼熱區(qū)。采用模糊聚類算法表明有9組基因對腫瘤轉
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