龍眼遺傳多樣性及親緣關系的ISSR分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、龍眼起源于我國,是我國南方特產(chǎn)果樹之一,種質(zhì)資源十分豐富。但長期以來,對龍眼資源的分類和利用,都是采用林奈和恩格勒的形態(tài)特征分類法,往往有些種、品種和品系在外貌和彩態(tài)特征上十分相似,但親緣關系和遺傳特性卻相差巨大,使得龍眼的分類地位及親緣關系一直存在著較多的爭議,并給龍眼的新品種培育和資源利用帶來困難。本試驗以廣西區(qū)域內(nèi)廣泛收集的60個龍眼品種為試材,應用lSSR分子標記技術,探討龍眼的分類和品種之間親緣關系的研究。試驗結果表明:

2、 1、通過對SDS、CTAB和改良CTAB法三種基因組DNA提取方法的比較,從純度、產(chǎn)率等方面考慮,認為改良CTAB法較為適合龍眼基因組DNA的提取。采用該方法提取的龍眼基因組DNA,經(jīng)電泳檢測,主帶清晰,無降解,分光光度計檢測,A<,200>/A<,280>的值在1.81-1.84之間,符合lSSR反應的要求。 2、通過對Tag DNA聚合酶,dNTP,模板DNA,Primer不同濃度的優(yōu)化試驗及對PCR反應程序的篩選,確定

3、了合適的反應體系和反應程序,從而建立了龍眼的l SSR分析技術體系。在20 μl反應體系中,模板DNA 75ng,Primer 5 μ moI, rTaq poI ymerase 1 U,dNTP 4 mmoI, Tris-HCl(pH 8.3)200 μmoI。反應程序為:預變性,94℃5min;變性,94、C1min;退火1 min;延伸,72℃2min;40個循環(huán),72℃延伸10min,4℃保存。 3、利用篩選得到的12條

4、lSSR引物對全部60個龍眼品種進行PCR擴增,共擴增產(chǎn)生119條總帶,其中共有帶52條,多態(tài)性條帶67條,多態(tài)性比率為56.30%。擴增片段長度分布在1OObp-2000bp之間,平均每個引物能擴出1O條帶。 4、運用NTSYS軟件,采用Dice相似系數(shù)分析ISSR反應結果,得到了60個品種間的親緣關系樹狀圖。以0.80作為相似系數(shù)的分界點,60個樣品通過基因組ISSR分成2大類:龍荔單獨為一類,另一類在相似系數(shù)0.85的水平

5、將其余的59個龍眼材料分為7個品種群:品種群I:東壁、未知實生2;品種群Ⅱ:立冬本;品種群Ⅲ:烏龍嶺、九葉烏、佳圓;品種群Ⅳ:靈龍、早白露;品種群V:車站、桂香、香蜜、小廣眼等12個品種(系);品種群Ⅵ:大烏圓、大廣眼、儲良、古山二號、石硤等27個個品種(系);品種群Ⅶ:青山水柜、洪武本、草灰本、處署本、桂明等12個品種(系)。 5、利用ISSR技術可以對基因組的所有序列直接分析,不受環(huán)境的影響,在分子水平上利用ISSR技術對6

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