幽門螺桿菌甲硝唑耐藥的比較蛋白質(zhì)組學初步研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、幽門螺桿菌(Helicobacter pylori,H.pylori)是慢性胃炎和消化性潰瘍的主要病因,并與黏膜相關(guān)性淋巴組織淋巴瘤(MALT)及胃癌的發(fā)生密切相關(guān),H.pylori感染嚴重危及人類的健康,因此,如何有效控制H.pylori感染亟需解決,但至今還沒有一種單一的抗生素可根除H.pylori感染,二聯(lián)抗生素療法對H.pylori的根除率也不高,目前,臨床抗H.pylori治療多采用在質(zhì)子泵抑制劑(PPI)或膠體鉍劑的基礎(chǔ)上加

2、兩種抗生素的三聯(lián)療法,常用抗生素包括甲硝唑(Metronidazole,MTZ)、克拉霉素(Clarithiomycin,CLA)、阿莫西林(Amoxicilin,AMX)。然而,近年來隨著抗生素的廣泛應(yīng)用,H.pylori對抗生素產(chǎn)生耐藥性呈上升趨勢,耐藥性的產(chǎn)生是根除H.pylori失敗的重要原因。 甲硝唑(Metronidazole,MTZ)是H.pylori三聯(lián)及四聯(lián)療法中常用的抗生素,屬于硝基咪唑類藥物,其本身為一種無

3、抑菌活性的藥物前體,需在細胞內(nèi)被硝基還原酶激活后才能發(fā)揮滅菌作用。由于MTz在人體內(nèi)具有活性高、穩(wěn)定性強及價格便宜等優(yōu)點,因而成為根除H.pylori感染的首選藥物之一,然而,MTZ的耐藥率在幾種治療H.pylori的抗生素中居高,H.pylori對甲硝唑的耐藥降低了包含有MTZ治療方案的療效,從而成為根治H.pylori失敗的重要原因。目前主要認為:H.pylori通過基因突變或基因表達調(diào)控,使作用于細菌的硝基還原酶含量降低,從而阻止

4、或抑制MTZ轉(zhuǎn)化為使細菌致死的還原產(chǎn)物,最終導致細菌對藥物的耐受。大多數(shù)研究推斷甲硝唑耐藥可能與rdxA、frxA、fdxB基因突變密切相關(guān),它們分別編碼氧不敏感的NADPH硝基還原酶、NADPH黃素氧化還原酶和鐵氧還原蛋白類似物。但也有研究者發(fā)現(xiàn)這些基因在部分敏感株和耐藥株中的表達一致,這提示MTZ耐藥株的形成過程中可能存在其它基因的參與,因此有必要進一步研究H.pylori對MTZ耐藥的新機制。 研究H.pylori對甲硝唑

5、的耐藥機制實際上就是揭示藥物作用細菌后信號轉(zhuǎn)導機制。基于基因組學技術(shù)的研究存在局限性,即使捕獲到細菌內(nèi)mRNA的信息仍不能代表基因產(chǎn)物蛋白質(zhì)的最終功能,這就需要我們從生命活動的執(zhí)行者蛋白質(zhì)入手,研究藥物干預后蛋白質(zhì)種類及數(shù)量的變化。目前蛋白質(zhì)組學研究較為流行的技術(shù)體系是應(yīng)用雙向凝膠電泳分離蛋白質(zhì)、質(zhì)譜分析鑒定所分離的蛋白質(zhì),應(yīng)用生物信息學數(shù)據(jù)庫對鑒定結(jié)果進行存儲、處理、對比和分析。幽門螺桿菌兩個菌株(H.pylori26695和H.py

6、loriJ99)的全基因組序列測序已經(jīng)完成,利用現(xiàn)有的生物信息學資源,本研究旨在通過高通量的蛋白質(zhì)組學技術(shù)了解幽門螺桿菌在MTZ作用下由敏感株轉(zhuǎn)化為耐藥株的蛋白質(zhì)表達模式變化,為初步闡明幽門螺桿菌耐藥性的機制奠定基礎(chǔ)。據(jù)此,我們主要做了以下工作: 1、幽門螺桿菌甲硝唑耐藥株的體外誘導和鑒定 體外培養(yǎng)幽門螺桿菌26695(H.pylori26695),并利用藥物濃度連續(xù)倍增的方法建立H.pylori26695甲硝唑耐藥株,

7、分別測定用藥前后甲硝唑?qū).pylori26695的最低抑制濃度(Minimal inhibitory concentration,MIC),MIC值變化≧32倍時被確定為誘導出對抗生素耐藥的菌株,為保證抗生素耐藥株的穩(wěn)定性,連續(xù)培養(yǎng)細菌5代后進行回復實驗,再測定其MIC值,最后進行PCR擴增rdxA基因并測序檢測其是否發(fā)生突變。本研究結(jié)果證明我們成功誘導出穩(wěn)定的H.pylori26695甲硝唑耐藥株,其對甲硝唑的耐受濃度為敏感株的25

8、6倍,經(jīng)回復實驗耐藥株的MIC值前后保持一致,rdxA基因測序結(jié)果顯示3個位點發(fā)生插入突變,該工作為研究幽門螺桿菌對MTZ耐藥機制提供了實驗模型。 2、幽門螺桿菌甲硝唑敏感株與耐藥株蛋白質(zhì)組雙向電泳圖譜的構(gòu)建 分別收集H.pylori26695敏感株與耐藥株,提取細菌總蛋白,應(yīng)用等電聚焦電泳(IEF)將菌體蛋白質(zhì)在不同pH梯度進行分離,然后用SDS—PAGE電泳技術(shù)根據(jù)分子量的不同在聚丙烯酰胺凝膠上電泳進一步分離;通過雙

9、向凝膠電泳(2—DE)技術(shù)分離菌體蛋白,蛋白質(zhì)顯色使用銀染法,用掃描儀獲取蛋白質(zhì)雙向凝膠電泳圖譜,利用ImageMastet2DElite軟件進行圖像分析,尋找敏感株與耐藥株的差異性蛋白質(zhì)斑點。結(jié)果發(fā)現(xiàn)在H.pylori耐藥株中有55個蛋白斑點表達差異顯著。 3、幽門螺桿菌甲硝唑敏感株與耐藥株的差異表達蛋白的質(zhì)譜鑒定 利用基質(zhì)輔助激光解吸電離—飛行時間質(zhì)譜儀(MALDI—TOF—TOF)對表達差異性的蛋白質(zhì)點進行MAlD

10、I—TOF—TOF質(zhì)譜分析,共得到24個蛋白質(zhì)點的可靠信息,23個蛋白質(zhì)點在耐藥株中的表達升高,1個蛋白質(zhì)點在耐藥株中表達降低。通過網(wǎng)絡(luò)蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(http://www.matrixscience.com and http://www.expasy.ch/tools/peptident.htm)搜索對比后,這些蛋白質(zhì)分別涉及細胞生長、合成與代謝以及壓力反應(yīng)等生物學功能。本研究結(jié)果提示H.pylori26695甲硝唑耐藥株的形成涉及到多

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