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文檔簡介
1、RNA沉默是一種轉錄后基因沉默現(xiàn)象,幾乎存在于所有的真核生物中。RNA沉默途徑調控真核生物的生長發(fā)育,防御病毒入侵以及維持生物體基因組的穩(wěn)定。RNA沉默過程需要Argonaute,Dicer,RNA dependent RNA polymerase和Qip(QDE-2的互作蛋白)等的參與。甘藍枯萎病是在全世界范圍內甘藍種植區(qū)都有發(fā)生的一種維管束土傳病害,對甘藍的生產造成極大危害,甘藍枯萎病病原菌為甘藍?;图怄哏牭毒‵usarium
2、oxysporum f. sp.conglutinans)。本文以甘藍?;图怄哏牭毒硇》N1號A8為代表,通過基因敲除尖孢鐮刀菌中Qip基因,比較分析敲除突變株和野生型菌株的差異,研究Qip基因的功能。為枯萎病生理機制和致病機理的研究提供進一步的理論基礎。具體研究內容如下:
1、基于12種不同?;图怄哏牭毒蚪M測序分析,我們用脈胞菌(N.crassa)中Qip(QDE-2)蛋白序列查找比對NCBI里12種不同?;图怄?/p>
3、鐮刀菌所有注釋蛋白,初步發(fā)現(xiàn)有一類蛋白在12種不同?;图怄哏牭毒袠O其保守,且只有一個高度保守的結構域DEDDh,距離N末端22-122個氨基酸殘基。DEDDh結構域屬于3’-5’核酸外切酶家族。MEGA6軟件比對12種尖孢鐮刀菌Qip蛋白序列,結果顯示,相似度達99%,都是由495個氨基酸殘基組成,只有15個氨基酸差異,說明Qip蛋白在12種尖孢鐮刀菌中是保守的。同時對12種不同?;图怄哏牭毒鶴ip基因進行了克隆,說明生物信息學預
4、測的可靠性。
2、提取甘藍?;图怄哏牭毒腞NA,RT-PCR結果顯示Qip基因是表達的。我們用甘藍專化型尖孢鐮刀菌為材料進行基因敲除,敲除原理是利用基因同源重組技術。我們在pKOV21載體中潮霉素基因的上下游分別進行了兩次雙酶切對應連接Qip基因序列的上下游側翼序列。制備甘藍專化型尖孢鐮刀菌的原生質體,以備后面遺傳轉化使用。利用潮霉素抗性基因為正向篩選標記,新霉素抗性基因為負向篩選標記,首先篩選在含有潮霉素平板上生長的轉化
5、子,然后將轉化子轉接到含有新霉素的平板上進行二次篩選(新霉素板上生長受抑制)。突變株PCR驗證結果顯示Qip目的基因已經被敲除,Southern雜交結果顯示△Qip突變株中只發(fā)生一次同源重組事件。
3、Qip基因與菌絲生長發(fā)育和致病力相關。突變體菌絲生長速率較野生型要慢,菌絲分支也比野生型菌絲分支多,說明Qip基因在菌絲的營養(yǎng)生長方面起重要的調控作用;對分生孢子的形態(tài)沒有影響;對甘藍的侵染結果表明,△Qip突變株對甘藍的致病力
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