基于RNA-Seq技術(shù)的長江三角洲白山羊優(yōu)質(zhì)筆料毛性狀研究及皮膚毛囊結(jié)構(gòu)的觀察.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、長江三角洲白山羊是國內(nèi)外唯一以生產(chǎn)優(yōu)質(zhì)筆料毛為特征的肉、皮、毛兼用型山羊品種,其所生產(chǎn)的優(yōu)質(zhì)筆料毛是制作高檔毛筆的獨特原料。長江三角洲白山羊是我國珍貴的不可替代的種質(zhì)資源,由于其獨特的產(chǎn)毛性能,又有筆料毛山羊之稱。目前,對長江三角洲白山羊優(yōu)質(zhì)筆料毛性狀的研究主要集中在宏觀領(lǐng)域,在分子水平方面的研究尚未深入開展,本研究是在本課題組前期相關(guān)分子機(jī)制研究的基礎(chǔ)上,主要是通過RNA-Seq技術(shù)對長江三角洲白山羊優(yōu)質(zhì)筆料毛性狀做進(jìn)一步研究,以深入

2、探討該性狀形成的分子機(jī)理。
  本試驗通過對長江三角洲白山羊優(yōu)質(zhì)筆料毛型和非優(yōu)質(zhì)筆料毛型山羊皮膚轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行高通量測序,旨在篩選可能影響長江三角洲白山羊優(yōu)質(zhì)筆料毛性狀的重要基因及相關(guān)通路,并通過PCR-SSCP技術(shù)對相關(guān)基因做多態(tài)性分析。同時利用冷凍切片技術(shù)來比較優(yōu)質(zhì)筆料毛型與非優(yōu)質(zhì)筆料毛型個體頸脊部及背部皮膚毛囊的結(jié)構(gòu),旨在尋找兩種性狀毛囊結(jié)構(gòu)的區(qū)別。
  本研究得到以下結(jié)論:(1)優(yōu)質(zhì)筆料毛型和非優(yōu)質(zhì)筆料毛型山羊共有差異表

3、達(dá)基因295個;以非優(yōu)質(zhì)筆料毛型山羊為對照,在優(yōu)質(zhì)筆料毛型山羊皮膚組織中,表達(dá)上調(diào)基因132個,表達(dá)下調(diào)基因62個,特異表達(dá)基因有101個。(2)根據(jù)差異表達(dá)基因GO顯著性富集分析、代謝通路顯著性富集分析和表達(dá)量差異倍數(shù),篩選出MAP3K1基因和MAPK信號通路可能在長江三角洲白山羊優(yōu)質(zhì)筆料毛性狀形成過程中起重要作用。(3) NCBI中山羊MAP3K1基因的十個SNP錯義位點在優(yōu)質(zhì)筆料毛型和非優(yōu)質(zhì)筆料毛型山羊個體中未發(fā)現(xiàn)。(4)優(yōu)質(zhì)筆料

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