沙田柚配子體自交不親和花柱消減文庫的構建及差異表達基因的分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、沙田柚(Citrus grandis var. Shatinyu Hort.)為廣西的名優(yōu)水果,屬典型的配子體自交不親和植物,是研究配子體自交不親和機理的好材料。然而嚴重的自交不親和使沙田柚必須通過人工授粉才能結果,增加了生產成本。因此,研究沙田柚的自交不親和機理具有重要生產實踐價值和理論意義。 本研究以沙田柚自、異交花柱為材料,構建了沙田柚自交不親和花柱抑制性消減雜交(suppression subtractive hybri

2、dization,SSH)正反向cDNA文庫,并對表達序列標簽(expressed sequence tag,EST)進行了分析研究。 藍白斑檢驗結果表明,正向SSH文庫重組率為95%,PCR檢測表明插入片段的平均長度250bp左右。隨機挑選文庫中的80個陽性克隆進行測序,去除測序不好的EST,共獲得67條測序較好的序列,剔除37條重復序列以及去載體后少于100bp的序列,共得到差異EST序列30條。這些序列通過BLASTx和B

3、LASTn軟件對基因庫(GenBank)中的非冗余(non-redundant)數(shù)據庫進行序列相似性檢索,其中23條通過BLASTx搜索具有明確的功能對比結果,根據預測的功能進行GO(gene ontology)分類,結果表明:10條與催化活性相關,占43.48%;3條與酶活性調節(jié)相關,占13.04%;2條與轉錄調控活性相關,占8.70%;另與信號傳遞活性、運輸、及生理學途徑相關的各1條,占4.35%;還有4條未作分類,占17.39%。

4、 此外,還有7條EST序列在BLASTx搜索中沒有得到功能比對結果,但通過BLASTn搜索,有1條與野生種三淺裂野牽牛的自交不親和S-位點序列(Ipomoea trifida DNA,self-incompatibility(S-) locus region,haplotype:S1)具有較高的同源性,其相似度均為88%。另1條EST序列與蘋果的S9-Rnase基因(Malus x domestica MdSFBB9-alpha

5、,S9-Rnase,MdSFBB9-beta genes,complete cds,Psi-SFBB9-alpha,Psi-SFBB9-beta pseudo genes)的相似度達89%,另有2條與Nicotiana benthamiana(煙草)isopentenyl /dimeth-ylallyl diphosphate isomerase(異構酶) mRNA,partial cds及Arabidopsis thaliana(擬南

6、芥)LAS1 (Lanosterol synthase 1);catalytic/lyase(裂解酶)(LAS1) mRNA,complete cds有較高的相似度,分別為85%和87%。 反向文庫中,隨機挑取的34個陽性克隆檢測后測序,去除測序不好的EST,共獲得質量較好的EST序列27條,剔除重復的序列,共得到差異EST序列24條。這些序列通過BLASTx軟件對基因庫(GenBank)中的非冗余(non-redundant)

7、數(shù)據庫進行序列相似性檢索,搜索后均有明確的功能對比結果,根據預測的功能進行GO分類,結果表明:它們與催化活性及酶調節(jié)活性功能相關性最大,分別占29.17%,如葡萄糖基轉移酶、幾丁質酶、脯氨酸寡肽酶、組氨酸激酶等,其余的一些分別與細胞成分(占16.67%)、結合(占8.33%)以及生理學途徑(占4.17%)等相關。 綜合以上研究,意味著決定沙田柚配子體自交不親和的可能不僅僅是S等位基因,也許是許多影響因子綜合作用的結果。沙田柚配子

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