人肝癌細胞中DHRS4LI選擇性剪切新亞型的鑒定和分析.pdf_第1頁
已閱讀1頁,還剩49頁未讀 繼續(xù)免費閱讀

下載本文檔

版權說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內容提供方,若內容存在侵權,請進行舉報或認領

文檔簡介

1、全反式維甲酸(all-trans Retinoic Acid,atRA)是體內類激素樣生理活性物質,在哺乳動物包括人類,成體內atRA 濃度過高或過低都可能會導致各種疾病和腫瘤的發(fā)生。在體內,atRA 是由維生素A(vitamin A )也稱視黃醇(Retinol)經兩步代謝生成,其中間代謝產物為視黃醛(Retinal)。成體內Retinal的生理作用劑量范圍也很窄,過高或過低均可會對機體產生不利影響。因此,體內atRA和Retinal

2、的代謝均受到嚴格精細的調控作用,整個代謝過程是一個由多酶參與的調節(jié)過程。
   近年來本課題組一直致力于一種全稱為輔酶Ⅱ依賴性視黃醇脫氫/還原酶(NADP(H)-dependent retinol dehydrogenase/ reductase,NRDR )的短鏈脫氫酶(short-chain dehydrogenase/reductase,SDR )的研究。NRDR 最早從兔肝細胞質溶膠中純化得到,是atRA代謝中的限速酶,

3、具有很高的視黃醇氧化、視黃醛還原活性,且廣泛分布于哺乳動物組織中。較之于短鏈脫氫酶家族中已知的其它成員,NRDR 在生理條件下表現(xiàn)出更強的視黃醛還原活性,因此,它在維持體內RA 及Retinal的代謝平衡中發(fā)揮重要的調節(jié)作用。
   Genebank中登陸號為AB045133的cDNA 被認為是NRDR的編碼基因,稱為DHRS4。
   人DHRS4基因簇有三個基因拷貝,分別為DHRS4,DHRS4L2與DHRS4L1(

4、又稱為DHRS4X ),其中前二者相似性很高(90%-98%;≥1kb )屬于片段復制(SegmentalDuplication)。DHRS4L1與DHRS4和DHRS4L2 之間的同源性分別為77.8%和77.7%。在研究基因表達與調控的過程中,我們發(fā)現(xiàn)DHRS4基因簇的3個拷貝基因存在非常復雜的轉錄及選擇性剪接方式,從而產生多種選擇性剪接亞型,這些剪接亞型在不同組織中表達情況的差異具有重要的臨床意義。本研究從人肝癌細胞HepG2中鑒

5、定出DHRS4L1 選擇性剪接新亞型,檢測其在不同組織和細胞中的表達情況,并探討其臨床意義。
   我們首先采用RACE(cDNA 末端快速擴增法)方法成功地從HepG2 細胞中獲得選擇性剪接新亞型的3 ’末端cDNA 序列,鑒定其結構推測其5 ’末端cDNA 序列,進而得到其cDNA 序列,全長1117bp;運用生物信息學方法對新亞型序列進行分析比對發(fā)現(xiàn),該新亞型的cDNA 序列與DHRS4LI基因高度同源,命名為DHRS4L

6、1A1 ;通過人基因組Blast分析,該新亞型DHRS4L1A1 由于選擇性剪接造成了第3~7 外顯子丟失,并保留第2 外顯子和第3 外顯子之間一段長度為85bp內含子序列,結構為E1-E2-insertion-E8-E9-E10 ;通過查找開放閱讀框架,發(fā)現(xiàn)該剪接新亞型的可閱讀框架在1~699bp之間,預測其編碼的蛋白質序列為232個氨基酸,具有SDR 家族2個保守的模序TAXXXGXG與YXXSK 及過氧化物酶體定位信號SRL。用R

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網頁內容里面會有圖紙預覽,若沒有圖紙預覽就沒有圖紙。
  • 4. 未經權益所有人同意不得將文件中的內容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內容的表現(xiàn)方式做保護處理,對用戶上傳分享的文檔內容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內容負責。
  • 6. 下載文件中如有侵權或不適當內容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準確性、安全性和完整性, 同時也不承擔用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

最新文檔

評論

0/150

提交評論