1、蛋白質是人體各項生理功能的參與者和執(zhí)行者,對蛋白質結構、功能和調控機制的研究將有助于直接闡釋千百年來生命體為適應環(huán)境的變化而形成的運行機制和規(guī)律。為人類研究生命的起源、進化、疾病治療等提供最直接的依據(jù)。與此同時蛋白質本身的存在形式、相互之間的調控規(guī)律、空間結構以及相互作用等,作為蛋白質研究中的基本問題,也都依賴于對蛋白質直接而深入的研究。本論文通過生物信息學的方法,對動物多肽毒素整理與歸納,建立的當今世界最大動物毒素數(shù)據(jù)庫ATDB的過程

2、,同時討論了新的策略構建質譜原始數(shù)據(jù)提取算法對蛋白質鑒定的影響。
　　 動物毒素數(shù)據(jù)庫(Animal Toxin Database/ATDB)的建立:動物多肽毒素大體上通過以下兩種途徑得到:(1)提取動物毒腺內mRNA,通過對mRNA序列的翻譯和表達后,經蛋白質測序得到；(2)提取有毒動物粗毒,經分離純化得到純品后經蛋白質測序得到。通過幾十年的深入研究,多種類型的動物毒素數(shù)據(jù)發(fā)表在許多文章中,其中包括毒素序列、結構、分子動力學特

3、征以及功能信息等多種相關信息,但它們絕大部分都零散的出現(xiàn),而且它們的各項特性沒有形成統(tǒng)一的描述,這樣既不利于對動物毒素形成相對統(tǒng)一的認識,也不便于研究者的查找與分析,動物毒素數(shù)據(jù)庫(ATDB)就是在此背景下建立的。其貢獻不僅僅在于將零散的數(shù)據(jù)集中,而且在收集整理的同時針對動物多肽毒素以及其重要的靶標分子的各項特征建立了一套通用的描述詞匯,對動物毒素以及離子通道進行了嚴格的描述,從而避免了相互之間混淆,是全球第一套針對動物毒素分子和靶標分

4、子的注釋詞匯。通過對動物多肽毒素和靶標分子的注釋,本論文對它們之間的相互作用關系進行了梳理,最終構建了它們的相互作用網絡并繪制成圖。這大大地提高了動物多肽毒素數(shù)據(jù)的直觀性和可讀性,為動物多肽毒素研究者提供了一個宏觀而全面的平臺。
　　 質譜數(shù)據(jù)的提取方法研究:使用質譜技術進行高通量蛋白質鑒定已成為當前實驗室鑒定蛋白質的常規(guī)方法和基本手段,通過測量蛋白質酶解后及碰撞碎裂后肽段的質量,通過檢索已知蛋白質數(shù)據(jù)庫的信息來鑒定蛋白質。在此