全外顯子測序發(fā)現(xiàn)遺傳性心臟傳導疾病致病基因SCN5A新突變.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、背景:全外顯子測序是近年來逐步興起的一種第二代測序技術。通過外顯子捕獲芯片以及邊合成邊測序技術,全外顯子測序可在極短時間內獲得海量的測序信息。與傳統(tǒng)的Sanger測序法相比,它具有高效便捷的特點,可以以相對低廉的成本同時完成上萬個基因的測序。自2009年美國學者Ng等首次運用全外顯子測序分析單基因孟德爾遺傳病以來,目前通過此方法已有數(shù)十個遺傳病的致病基因被發(fā)現(xiàn)。運用全外顯子測序對遺傳性心臟病的研究多集中于心肌病,相繼發(fā)現(xiàn)了致心律失常性右

2、室心肌病致病基因DES、肥厚型心肌病致病基因MRPL44、MTO1、AGK、MRPL3、AARS2以及擴張性心肌病致病基因BAG3、GATAD1,而有關心律失常的報道相對較少。本課題通過全外顯子測序研究了一個遺傳性心臟傳導疾病家系,旨在找出致病基因,為疾病發(fā)病機制的研究提供參考資料,同時也為將來產前診斷、遺傳咨詢以及基因診斷提供幫助。
  目的:探查一個遺傳性心臟傳導疾病家系的致病基因。
  方法:首先通過心電圖與詢問病史對

3、一個包含5代37人的大家系進行心臟傳導疾病的篩查,并采集外周血樣以提取gDNA;接著選取其中的三名患者與一名正常人進行全外顯子測序,并利用dbSNP數(shù)據(jù)庫、TGP數(shù)據(jù)庫、YH數(shù)據(jù)庫以及ESP數(shù)據(jù)庫對測序結果中的已知變異進行篩查;再在去除已知變異后的結果中選出三名患者共有而正常人沒有的疑似突變;然后運用Mutation Taster、SIFT以及Poly Phen-2對疑似突變進行預測,選出致病性較高的候選突變;最后利用PCR擴增以及Sa

4、nger測序法將候選突變在家系內與家系外進行驗證,并在HGMD數(shù)據(jù)庫、Pubmed數(shù)據(jù)庫以及Google scholar上進行查重。
  結果:該家系遺傳性心臟傳導疾病呈現(xiàn)常染色體顯性遺傳特點,家系中存在10名患者。經過全外顯子測序、公共數(shù)據(jù)庫篩查、疑似變異分析以及功能軟件預測后,留下12個候選突變。經過家系內與家系外驗證發(fā)現(xiàn)僅有SCN5A上的雜合變異c.4485 C>A(p.Y1495X)與心臟傳導疾病發(fā)生共分離。該變異未被報道

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