中國部分地方黃牛品種遺傳多樣性研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本研究以中國部分地方黃牛皖南牛、吉安黃牛、威寧黃牛、務川黑牛、隆林黃牛、潿洲黃牛、秦川牛、迪慶黃牛、三江牛、徐聞牛和三個引進品種西門塔爾牛、夏洛來牛、德國黃牛為研究對象,采用聯(lián)合國糧農(nóng)組織(FAO)和國際動物遺傳學會(ISAG)聯(lián)合推薦的15對微衛(wèi)星DNA引物,以ABI3100-Avant全自動基因序列分析儀為平臺,結合熒光.多重PCR技術,檢測了10個中國地方黃牛和3個引進品種,共計756個個體的基因型,并對標記后擴增產(chǎn)物進行序列分析

2、。通過計算等位基因數(shù)和頻率、特有等位基因數(shù)、雜合度、多態(tài)信息含量、有效等位基因數(shù)、Nei氏遺傳距離(D<,A>)和Nei氏標準遺傳距離(D<,S>),采用非加權組平均法等方法,分析了中國地方黃牛群體內和群體間的遺傳變異。結果如下: 1、在15個微衛(wèi)星座位上共檢測到了242個等位基因,每個座位平均等位基因是16.1個,UKSTS034座位的等位基因最多,達到26個,ILSTS054和BM1824座位的等位基因最少,為10個,其余座

3、位等位基因在11~22之間。13個黃牛品種中,平均等位基因數(shù)在7~11個,三江牛和西門塔爾牛、德國黃牛的平均等位基因數(shù)最少,威寧黃牛、務川黑牛和隆林黃牛的平均等位基因數(shù)最多。13個黃牛品種的遺傳多樣性豐富,遺傳變異較大。 2、在13個黃牛品種中,共發(fā)現(xiàn)32個特有等位基因,除務川黑牛、隆林黃牛和德國黃牛沒有特有等位基因,其他黃牛都至少在某一微衛(wèi)星座位上有一特有等位基因,其中秦川牛和迪慶黃牛的特有等位基因數(shù)最多,達到5個。在15個微

4、衛(wèi)星座位中,ILSTS054和SPS115兩個座位沒有發(fā)現(xiàn)特有等位基因,TGLA122的特有等位基因數(shù)最多,為6個。13個中外黃牛品種在15個微衛(wèi)星座位中的特有等位基因頻率都比較低,只有夏洛來牛在ETH185座位上的243bp等位基因頻率(0.052)和德國黃牛在TGLA122座位上的180bp等位基因頻率(0.112)大于0.05。13個中外黃牛品種在15個微衛(wèi)星座位中一共發(fā)現(xiàn)19個優(yōu)勢等位基因,等位基因頻率都大于0.50。

5、3、13個黃牛品種在15個微衛(wèi)星座位上,多態(tài)信息含量(PIC)、群體雜合度和有效等位基因數(shù),分別為0.3232~0.8973,0.3340~0.9043和1.5016~10.4534。務川黑牛在ILSTS034座位上最高,西門塔爾牛在INRA032座位上最低。ILSTS034座位的平均多態(tài)信息含量和平均雜合度都最高,達到0.8250和0.8381,HEL13座位的最低,分別為0.6052和0.6479;迪慶黃牛的這三項指標最高,分別為0

6、.7744,0.8003和5.3573,德國黃牛的最低,分別為0.6203,0.6651和3.3308。13個黃牛品種遺傳變異較大,迪慶黃牛的遺傳變異最大,德國黃牛最小。本研究所選用的15個微衛(wèi)星座位,屬于高度多態(tài)性座位,可以用于黃牛的遺傳多樣性的分析研究。 4、10個地方黃牛品種與3個引進品種之間有很大差異,兩者之間的遺傳距離較大。10個地方黃牛品種中,皖南牛、吉安黃牛、隆林黃牛、潿洲黃牛和徐聞牛之問的遺傳距離都很小(D<,A

7、>為0.0646~0.1286,D<,S>為0.0356~0.0987);而三江牛與其它地方黃牛品種間的遺傳距離較大,為0.1373~0.2647(D<,A>)和0.1628~0.3466(D<,S>)。在3個引進品種之間的遺傳距離較小。 5、13個黃牛品種聚為三大類,第一類為皖南牛、吉安黃牛、隆林黃牛、潿洲黃牛和徐聞牛;第二大類為威寧黃牛、務川黑牛、迪慶黃牛、秦川牛和三江牛;第三大類為西門塔爾牛、夏洛來牛和德國黃牛三個外來品種

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