轉(zhuǎn)錄因子Ikaros在肺癌發(fā)生發(fā)展中的功能和調(diào)控.pdf_第1頁
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1、天津醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文轉(zhuǎn)錄因子Ikaros在肺癌發(fā)生發(fā)展中的功能和調(diào)控姓名:陳娜申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:碩士專業(yè):生物學(xué);生物化學(xué)與分子生物學(xué)指導(dǎo)教師:劉喆201205天津醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文SKBR3細(xì)胞;運(yùn)用shRNA成功下調(diào)了Ikaros在H69細(xì)胞的表達(dá);運(yùn)用構(gòu)建質(zhì)粒和細(xì)胞轉(zhuǎn)染技術(shù)成功在A549細(xì)胞中過表達(dá)Ikaros;細(xì)胞的形態(tài)變化:在H69細(xì)胞中下調(diào)Ikaros的表達(dá)豐度之后,細(xì)胞的形態(tài)由原來的懸浮狀態(tài)逐漸變?yōu)橘N壁狀態(tài);在A549細(xì)

2、胞中上調(diào)Ikaros的表達(dá)豐度后,原來的貼壁細(xì)胞逐漸變得貼壁不緊了;細(xì)胞劃痕試驗(yàn)和Transwell試驗(yàn)結(jié)果:Ikaros的過表達(dá)能夠抑制A549細(xì)胞的遷移能力和侵襲能力;RealTimePCR結(jié)果:檢測(cè)出Ikaros可抑制和細(xì)胞轉(zhuǎn)移和侵襲相關(guān)基因(Nanog、ErbB2、SIPl、TGFcz、ⅡSMA)的表達(dá);免疫組化實(shí)驗(yàn)結(jié)果:檢測(cè)到Ikaros在癌旁組織中不表達(dá),在人的肺癌組織中低分化的腫瘤細(xì)胞中Ikaros的表達(dá)量多于高分化的腫瘤

3、細(xì)胞。2DNA去甲基化是Ikaros在肺癌細(xì)胞中異位表達(dá)的主要調(diào)控機(jī)制利用BLAST軟件對(duì)人和小鼠的Ikaros基因序列進(jìn)行比對(duì),發(fā)現(xiàn)11個(gè)同源序列,分別為homol,hom02,hom03,hom04,hom05,hom06,hom07,hom08,hom09,homol0和homoll:ChIP實(shí)驗(yàn)結(jié)果:H3K27乙?;虷3K4單甲基化(這兩種修飾是增強(qiáng)子的標(biāo)志)在U937細(xì)胞系中的同源序列hom04、hom05和homoll有富

4、集,而在H1155和A549細(xì)胞中無富集,說明這三個(gè)同源序列是潛在的增強(qiáng)子,而這三個(gè)增強(qiáng)子在H1155細(xì)胞中不具有功能;3C結(jié)果顯示U937細(xì)胞中其啟動(dòng)子區(qū)與其上游的同源序列hom04、hom05和hom011在空間結(jié)構(gòu)上相互接近,H1155細(xì)胞沒有形成這樣的高級(jí)結(jié)構(gòu),進(jìn)一步證實(shí)hom04、hom05和homoll三個(gè)增強(qiáng)子只在U937細(xì)胞中活躍,在H1155細(xì)胞中盡管Ikaros異位表達(dá),但增強(qiáng)子不起作用;H3K9乙?;?、H3K4二甲

5、基化和三甲基化在U937細(xì)胞中的啟動(dòng)子區(qū)有明顯的富集,在H1155和A549細(xì)胞中沒有富集,說明組蛋白修飾的改變并非Ikaros異位表達(dá)的因素;Bisulfite—Sequencing實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明:在Ikaros表達(dá)的U937,H209,H1155細(xì)胞中的DNA甲基化程度明顯低于Ikaros不表達(dá)的A549,MDAMB231和Beas2B細(xì)胞,說明DNA去甲基化是Ikaros在肺癌細(xì)胞H1155表達(dá)的原因。結(jié)論:Ikaros在肺癌細(xì)胞的

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