中文病歷文本的時(shí)間信息提取研究.pdf_第1頁(yè)
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1、隨著臨床信息化的發(fā)展以及電子病歷、臨床決策支持等臨床信息系統(tǒng)的逐步采用,面向病歷文本的文本挖掘和信息提取研究成為醫(yī)學(xué)信息學(xué)研究的熱點(diǎn)。由于時(shí)間信息在病歷文本中的較高出現(xiàn)頻率,病歷文本中的時(shí)間信息及其關(guān)系提取對(duì)于實(shí)現(xiàn)醫(yī)療信息結(jié)構(gòu)化,促進(jìn)臨床決策支持、醫(yī)療信息挖掘等信息綜合利用具有重大意義。因此,本論文面向中文病歷文本,針對(duì)時(shí)間表達(dá)識(shí)別、時(shí)間信息規(guī)范化和時(shí)間關(guān)系提取三個(gè)關(guān)鍵問題開展研究。
   時(shí)間表達(dá)識(shí)別作為時(shí)序語義標(biāo)注的關(guān)鍵技術(shù)

2、之一,其結(jié)果的好壞直接影響時(shí)間信息提取的效果,因此專門針對(duì)醫(yī)學(xué)病歷語料的時(shí)間表達(dá)識(shí)別研究是進(jìn)行中文病歷文本中時(shí)間信息提取的必經(jīng)階段。本論文對(duì)涵蓋30多個(gè)科室的147份實(shí)際病歷中的時(shí)間表達(dá)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)并分類,提出了基于一套時(shí)間正則表達(dá)式和相鄰匹配原則的中文病歷文本時(shí)間表達(dá)自動(dòng)識(shí)別方法,實(shí)驗(yàn)表明該方法能基本覆蓋病歷文本中的時(shí)間表達(dá)信息。
   時(shí)間信息規(guī)范化是后續(xù)開展時(shí)間推理的基礎(chǔ),針對(duì)時(shí)間表達(dá)識(shí)別的結(jié)果,本論文提出了中文病歷文本中時(shí)間

3、信息參考時(shí)間的選取規(guī)律,針對(duì)不同種類時(shí)間信息采用不同的參考時(shí)間選取規(guī)則,計(jì)算出病歷文本中所述時(shí)間信息在日歷中的表示,并參考國(guó)際時(shí)間標(biāo)注標(biāo)準(zhǔn)制定了針對(duì)醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的時(shí)間規(guī)范化表示方法,實(shí)現(xiàn)了時(shí)間信息的規(guī)范化,為病歷文本中時(shí)間信息的后續(xù)利用提供標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù),該方法可涵蓋病歷文本語料中96%以上的時(shí)間信息,正確率可達(dá)91%。
   建立醫(yī)療事件與時(shí)間信息的關(guān)聯(lián)是開展病歷文本中時(shí)間信息自動(dòng)利用研究的驅(qū)動(dòng)力,為此本論文提出了一種基于條件隨機(jī)場(chǎng)(

4、CRF)的時(shí)間關(guān)系自動(dòng)提取算法。該機(jī)器學(xué)習(xí)方法以經(jīng)過醫(yī)學(xué)問題和時(shí)間信息規(guī)范化表示結(jié)果進(jìn)行標(biāo)注的病歷文本為訓(xùn)練內(nèi)容,時(shí)間關(guān)系結(jié)果標(biāo)注采用以醫(yī)學(xué)問題為中心的模式,即僅提取所關(guān)心醫(yī)學(xué)問題的時(shí)間屬性。在此方法框架下本論文以63份實(shí)際病歷作為實(shí)驗(yàn)文本深入分析了不同的CRF學(xué)習(xí)模板對(duì)于時(shí)間關(guān)系提取的影響,提出了時(shí)間關(guān)系提取中CRF學(xué)習(xí)模板設(shè)計(jì)的一般規(guī)律,實(shí)驗(yàn)中最佳模板情況下關(guān)系提取正確率可達(dá)86.94%。
   本論文通過以上三部分的有機(jī)結(jié)

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