1、茶樹是我國重要的經濟作物之一。近年來，已育成許多具有優(yōu)異性狀的茶樹品種。一方面，這些品種大多采用系統選種和雜交育種的方法選育而成，骨干親本類似，親緣關系比較接近，使品種的遺傳背景較窄。如果能從分子水平上揭示這些品種之間的親緣關系和遺傳結構，將為雜交育種時親本的選擇提供一定的科學指導。另一方面，隨著，新培育出的優(yōu)良品種越來越多，對茶樹品種的鑒別提出了更高的要求。SSR（Simple sequence repeat，簡單重復序列）分子指紋圖

2、譜鑒定技術具有簡便、迅速不受環(huán)境條件影響等優(yōu)點，非常適合品種鑒定。本研究以254個優(yōu)良茶樹品種為材料，從前期構建的遺傳連鎖圖譜上選出185個SSR標記，分析了我國茶樹品種的遺傳多樣性水平，并通過篩選出的核心引物，構建了較全面的茶樹品種分子指紋圖譜。主要研究結果如下：
　　1.從185個SSR標記中初步篩選出了128個擴增條帶清晰、穩(wěn)定的SSR標記。不同連鎖群上的SSR標記檢測到的平均等位基因數、基因型個數、多態(tài)性息含量均有較大差異

3、。根據引物擴增條帶易統計程度，PIC（Polymorphism information content，多態(tài)性息含量）和基因型個數，篩選了2套均勻分布于15連鎖群上的30對核心引物。理論上任意兩個品種可能混淆的概率為6.0×10-13。同時，通過標準誤的變化，250個茶樹品種遺傳多樣性研究至少需要30對SSR引物。
　　2.利用128個SSR標記分析了我國茶樹優(yōu)良品種的遺傳多樣性水平，在254個茶樹品種中共檢測到629個等位變異，

4、平均觀測雜合度HO為0.43，期望雜合度HE為0.54。Shannon信息指數（I）平均為1.03。PIC平均為0.5，基因多樣性指數平均為0.54。從地理區(qū)域來看，云南、廣東、重慶的品種基因多樣性水平較高，達到0.5以上；臺灣的品種遺傳多樣性水平最低，只有0.29。從不同時期分析，2000s育成品種的基因多樣性水平最高，達到0.54，其次是1990s，2010s，1980s最低。比較不同年代間平均遺傳距離的變化，發(fā)現1980s品種遺傳

5、距離為0.30，1990s上升到0.32，此后呈下降的趨勢?；谶z傳距離的N-J(Neighbor-joining)聚類將茶樹品種分為3個大類群，基于Structure數學模型的算法則將所有材料分為5個亞群。
　　3.應用毛細管電泳（Capillary electrophoresis，CE）熒光標記檢測分析手段與聚丙烯酰胺凝膠電泳（Polyacrylamide gel electrophoresis, PAGE）銀染檢測技術，選用