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文檔簡介
1、大電導鈣激活鉀離子(BK)通道是一類同時受控于膜電壓和胞內(nèi)鈣離子的特殊的鉀離子通道,它在很多重要的生理過程中有著非常重要的作用,如耳毛細胞的頻率調(diào)節(jié)和激素分泌、神經(jīng)遞質(zhì)的釋放、心率和血管的抗逆性等。因此,對BK通道結構及調(diào)控機理的研究對于神經(jīng)科學以及心血管疾病的研究都有著重要意義。
本論文利用BLAST對mslo1序列在蛋白質(zhì)結構數(shù)據(jù)庫(PDB 庫)中進行同源性搜索:利用MODELLER對搜索結果中得分較高的跨膜區(qū)S1-S
2、6進行同源建模,模板為Kv1.2通道的晶體結構(PDB ID,2R9R);而得分較低的N端部分則采用ROSETTA進行從頭計算得到;RCK結構直接利用hslo1的晶體結構(PDB ID,3NAF)。參考MthK 通道以及電鏡實驗結果組裝BK通道全結構。
通過與KCNQ1通道的序列比對,對比新得到的BK通道模型,發(fā)現(xiàn)S1上的兩個殘基(Y130、F131)和相鄰亞基的S5上的A250、以及孔區(qū)α螺旋上的W275之間形成了一個相
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