鯉免疫相關基因的挖掘及芯片構建.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、隨著水產養(yǎng)殖密度不斷增大,病害的侵襲已經嚴重制約的水產養(yǎng)殖也的健康發(fā)展,因此提高魚類對大規(guī)模突發(fā)性疾病的抗病能力以成為人們所關注的重點,傳統(tǒng)的藥物治療和預防不僅在魚體內造成殘留,也會對污染養(yǎng)殖環(huán)境,所以挖掘魚類免疫相關基因和利用基因芯片快速高通量的檢測成為人們研究的熱點。
  本研究獲得未注釋EST序列35,353條,經過基因功能的GO注釋鑒定出444條鯉魚(Cyprinus carpio)免疫相關序列,已知核酸序列的獲取48條鯉

2、魚免疫相關功能基因,共獲得鯉魚免疫相關功能序列492條;在37個人體免疫基因芯片上,每個芯片選取8-10個基因,共選取337個基因進行特異性引物設計,共設計出300個基因的特異性引物3107對,合成306對引物,經擴增條件的篩選共選出264對鯉魚免疫相關功能基因引物。
  本實驗用上述264對引物的PCR擴增產物作為基因芯片的探針,探針濃度為0.5μg/μL時,點樣效果最好;點樣時濕度為55,點直徑200μm,點間距300μm時,

3、點圓潤,大小均勻,且分布均勻無交叉;檢測樣品OD260/OD280值范圍為1.8-2.0,濃度300-500ng/μl時雜交效果最好;雜交時樣品和雜交液混合比例為1:6,雜交溫度為55℃時雜交效果最好,雜交背景較弱;用制備好的基因芯片對未染病鏡鯉和染病鏡鯉的脾組織進行基因表達差異的檢測,應用 QuantArray微陣列分析軟件,分析兩個樣品RNA起始量之間的差異,進行比值分析,確定差異表達的基因,在Dendritic&Antigen P

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