哲羅鮭免疫球蛋白重鏈序列研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、哲羅鮭在分類學上隸屬于硬骨魚綱(Osteichthyes)、輻鰭亞綱(Actinopterygii)、鯡形總目(Clupeomorpha)、鮭形目(Salmoniformes)、鮭亞目(Salmonoidei)、鮭科(Salmonidae)、鮭亞科(Salmoninae)、鮭屬(Salmo).具有個體大、生長速度快、肉質細嫩鮮美、營養(yǎng)價值豐富等特點.目前我國內陸冷水水域分布有2亞種,有溯河型及純淡水棲息種群之別.
  魚類是最早出

2、現免疫球蛋白的生物.免疫球蛋白基因序列在魚類進化分界處表現出了很大的變化,并且鮭科魚類起源于特殊的地理時期,因此對鮭科魚類的免疫球蛋白基因序列進行研究,對古生物地理學、古生態(tài)學、氣候變化及脊椎動物進化系統(tǒng)等許多方面均具有重要意義.就此,本文采用分子生物學和生物信息學相結合的方法,對哲羅(Huchotaimen)的免疫球蛋白重鏈可變區(qū)及恒定區(qū)序列進行研究和功能分析,并與虹鱒(Oncorhynchusmykiss)序列(Genbank登錄號

3、為S63348.1)進行相似性比較.
  從哲羅鮭主要免疫器官—脾臟獲得總RNA并采用RT-PCR技術獲得其免疫球蛋白(Immunoglobulin,Ig)重鏈cDNA克隆,獲得32條完整不重復可變區(qū)序列以及1條恒定區(qū)序列,經過BLUST網絡對比,結果顯示與GenBank報道的登錄號為S63348.1的虹鱒序列的相似性高達87.4%以上;對所得核苷酸序列進行結構域可變性分析可見,哲羅鮭Ig重鏈可變區(qū)VH中骨架區(qū)(framework

4、region,FR)部分相對保守,變異率較低;互補決定區(qū)(Complementaritydeterminingregion,CDRs)變異率較大,特別是CDR3區(qū)變異可達35.免疫球蛋白重鏈可變區(qū)VH中D和J片段的的隨機重排,外切酶的作用,以及在重排位點大量N,P片段的插入都大大增加了哲羅鮭免疫球蛋白重鏈可變區(qū)的多樣性.恒定區(qū)序列與斑點叉尾鮰(Ictaluruspunctatus)、草魚(Ctenopharyngodonidella)、

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