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文檔簡介
1、Wnt4(Wingless-related MMTV integration site4,無翅相關的小鼠乳房腫瘤病毒整合位點4)是Wnt家族重要的成員之一,Wnt蛋白是一種分泌型糖蛋白,通過自分泌或旁分泌作用,它們組成一個高度保守的信號分子家族.Wnt通路決定細胞的分化命運,在動物發(fā)育中起著廣泛的作用;而近來研究發(fā)現(xiàn),Wnt信號通路在生殖系統(tǒng)中也起著重要的作用,與生殖最相關的可能是非典型的Wnt/β-catenin信號通路。因此,對Wn
2、t4基因的克隆測序和初步分析,可以為研究豬的Wnt4基因的生物學功能和品種改良提供基礎的基因信息。
本文采用電子克隆的方法,結合RT-PCR和RACE技術,獲得了豬Wnt4基因的cDNA全序列。利用生物信息學方法預測了該蛋白的結構和功能,并進行了同源序列多重比對和分子系統(tǒng)發(fā)生分析。利用實時熒光定量( Real-time)PCR技術分析了豬Wnt4基因的mRNA在不同組織的相對表達水平。
1 Wnt4基因的克隆
3、測序
用人的Wnt4基因的cDNA全序列作為電子探針,分別從NCBI的dbEST和UniGene數(shù)據(jù)庫釣取了共5條豬的EST序列,將其輸入DNAstar-SeqMan程序,最后拼接出2個重疊群(Contig)序列。在此基礎上,利用Oligo6.0軟件手動設計引物,借助RT-PCR和RACE技術一方面驗證了電子克隆的正確性;另一方面擴增出cDNA全序列,長度為3232bp, GenBank登錄號為FJ759131.
4、 2 Wnt4蛋白的生物信息學分析
借助生物信息學網(wǎng)絡資源和軟件,預測出豬Wnt4基因開放閱讀框的長度為1254bp,編碼417個氨基酸殘基,且兩側分別是260bp的5’UTR和1718bp的3’UTR。通過對蛋白序列相似性檢索,預測出豬Wnt4蛋白含有一個信號肽,為分泌性蛋白質;不合明顯的疏水區(qū);定位于細胞外。而且確定其含有Wnt4結構域。推測豬Wnt4蛋白參與細胞的分化、發(fā)育和繁殖等過程。
3 Rea
5、l-time PCR分析Wnt4基因的組織表達譜
利用Real-time PCR技術對豬各組織的Wnt4基因的mRNA進行定量分析,基因表達量使用2-△△CT法進行處理,其中△△CT=(CT目的基因-CT內參基因),處理結果使用SPSS16.0進行單因素方差分析。結果表明:Wnt4基因在豬的不同組織中廣泛表達,但Wnt4基因在體內各組織中的表達豐度有差異,已證實該基因最初表達于腎小管間充質及未分化的性腺中。但經(jīng)過性別特異的
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