MALDi-TOF-MS分析雞群體遺傳特性及雪山雞肉質SNPs位點篩選.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、基質輔助激光解吸電離飛行時間質譜(MALDI-TOF-MS)技術是目前一種中高通量的SNPs分型平臺,能夠顯著提高SNP檢測的準確性。本研究通過MALDI-TOF-MS技術對13個群體10個候選基因的25個SNPs位點進行掃描檢測,對已報道的SNPs的存在與否進行進一步驗證。同時以雪山雞為試驗材料,對候選SNPs從DNA變異水平進行了肉品質相關的遺傳效應分析,以期為雪山雞的肉品質性狀的分子標記輔助選育提供理論基礎。
   1、本

2、研究利用飛行質譜分析法對肉質和抗性相關的重要的SNPs在13個群體的504個個體中進行了檢測,結果發(fā)現(xiàn)25個SNPs中的SNP2、SNP6、SNP9、SNP10、SNP19和SNP22不屬于先前報道的多態(tài)位點,其余的19個為有效SNPs。
   2、雪山雞ADSL基因SNP1、GARS-GART-AIRS基因SNP5、AIRC基因SNP7、PURH基因SNP11、UCP基因SNP12等5個SNPs同部分常規(guī)肉品質指標顯著相關。A

3、DSL基因的SNP1基因型與腿肌剪切力顯著相關,CT型個體極顯著高于CC和TT型個體(P<0.01);GARS-GART-AIRS基因的SNP5基因型與胸肌系水力顯著相關,TT型個體極顯著高于CC和CT型個體(P<0.01);AIRC基因的SNP7基因型與胸肌剪切力顯著相關,TT型個體顯著高于TC型個體(P<0.05);PURH基因的SNP11基因型與腿肌pH值顯著相關,TT型個體顯著高于TC型個體(P<0.05);UCP基因的SNP1

4、2基因型與腿肌pH值顯著相關,TC型個體顯著高于TT和CC型個體(P<0.05),TT和CC型個體之間差異不顯著(P>0.05)。
   3、AIRC基因SNP7以及GARS-GART-AIRS基因SNP4、SNP5與胸肌肌苷酸含量顯著相關(P<0.05),SNP7中發(fā)現(xiàn)TC雜合型個體胸肌肌苷酸含量顯著高于TT型個體(P<0.05);SNP4中發(fā)現(xiàn)CC型個體胸肌肌苷酸含量顯著高于AA和AC型個體(P<0.05),AA和AC型個體

5、之間差異不顯著;SNP5中發(fā)現(xiàn)TT型個體胸肌肌苷酸含量極顯著高于CC和CT型個體(P<0.01),CC和CT型個體之間差異不顯著。腿肌肌苷酸含量同胸肌肌苷酸含量的變化趨勢一致,但是差異并不顯著,初步認為這些SNPs應是肌肉肌苷酸含量的候選標記。
   4、雪山雞A-FABP基因SNP13與腿肌肌內(nèi)脂肪含量顯著相關(P<0.05);THRSP基因SNP14與胸肌肌內(nèi)脂肪含量達到了顯著關聯(lián)水平(P<0.05)。SNP12(UCP基因

6、)、SNP13、SNP14三個位點與部分胸肌、腿肌脂肪酸含量達到了關聯(lián)顯著水平(P<0.05)。在胸肌中發(fā)現(xiàn),SNP12的TT型個體中胸肌C18:1n9c含量、C18∶2n6c含量均顯著高于TC和CC型個體(P<0.05);在腿肌中發(fā)現(xiàn),SNP12的TT型個體的C16∶0含量顯著高于TC和CC型的個體(P<0.05);SNP13中發(fā)現(xiàn)TT型個體胸肌C16∶0含量顯著高于CT和CC型個體(P<0.05);SNP14的GA雜合型個體中胸肌的

7、C16∶0含量、C18:1n9c含量、C18∶2n6c含量均顯著高于GG和AA型個體(P<0.05)。初步認為UCP基因、A-FABP基因和THRSP基因是肌肉脂肪性狀的候選標記。
   5、單倍型分析結果顯示,雪山雞ADSL和GARS-GART-AIRS基因單倍型H7H8(TTCCCT)個體的胸肌肌苷酸含量顯著高于其他型個體(P<0.05),表明H7H8型個體可能是肌苷酸含量的優(yōu)勢個體;UCP和THRSP基因構成的單倍型對肌內(nèi)

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