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文檔簡介
1、生物醫(yī)學文獻是展示和傳播生物醫(yī)學知識的有效途徑,如何從爆炸性增長的文獻數(shù)據(jù)中快速準確且自動地定位人們所需要的信息,成為了各領域精英重點關注的問題之一。而生物醫(yī)學信息抽取技術的主要目的就是從非結構化的生物學和醫(yī)學文本數(shù)據(jù)中自動解鎖結構化語義信息。其中,生物醫(yī)學事件抽取旨在檢測細粒度的實體之間的多元語義關系,并將事件的詳細信息以結構化形式展示給人們。本文以生物醫(yī)學事件抽取作為研究的關鍵問題,將其分為兩個子問題進行研究:觸發(fā)詞識別和元素檢測。
2、
傳統(tǒng)的生物醫(yī)學事件觸發(fā)詞識別方法基于人工設計特征、構建特征向量,所利用的信息有限。因此,為了避免人工設計特征的復雜性,提升系統(tǒng)的泛化能力,本文利用神經(jīng)網(wǎng)絡自動從單詞的語義空間中學習候選實例的特征表示,提出兩種觸發(fā)詞識別方法。提出基于卷積神經(jīng)網(wǎng)絡的觸發(fā)詞分類方法,利用卷積神經(jīng)網(wǎng)絡對局部特征的學習能力來識別觸發(fā)詞;提出基于雙向長短時記憶神經(jīng)網(wǎng)絡和條件隨機場的觸發(fā)詞標記方法,利用長短時記憶神經(jīng)網(wǎng)絡對上下文信息的有效融合與學習,并充
3、分發(fā)揮條件隨機場考慮全局信息的優(yōu)點,實現(xiàn)事件觸發(fā)詞的標記。
使用雙向長短時記憶神經(jīng)網(wǎng)絡和 Attention機制相結合的方法進行生物醫(yī)學事件元素檢測,抽取上下文特征、距離特征和候選對屬性特征,并從構建的語義空間映射詞向量獲取語義特征,使用雙向長短時記憶神經(jīng)網(wǎng)絡對候選對實例特征之間的時序信息進行建模與學習。同時,進一步引入Attention機制來關注候選對實例中的重要特征,賦予它們更大的注意力概率,并根據(jù)所學習到的權重值對模型輸
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