1、日本沼蝦(Macrobrachium nipponense)自然分布于中國、日本、越南以及緬甸等地區(qū)，廣泛分布于我國各地淡水水域。這一物種資源量在長江中下游地區(qū)是非常豐富的，特別是太湖地區(qū)。該品種在中國和日本是重要的淡水經(jīng)濟蝦類。近年來，由于過度捕撈，自然棲息地的退化使得日本沼蝦野生群體的種群遺傳結(jié)構(gòu)和資源量急劇下降。因而開展遺傳多樣性分布和野生群體遺傳結(jié)構(gòu)的研究對制定保護措施顯得尤為重要。
　　利用ISSR分子標記技術(shù)對江蘇長江

2、和太湖2個地區(qū)日本沼蝦群體的遺傳多樣性進行了分析。結(jié)果顯示：75個ISSR引物中有6個引物能擴增出清晰條帶，6個引物對兩個群體各24個樣品擴增出34個位點。日本沼蝦長江和太湖兩群體的多態(tài)位點比率為76.47％和73.53％，Shannon’s指數(shù)分別為0.3480和0.3465，Shannon's指數(shù)估算和AMOVA分析均顯示日本沼蝦的遺傳變異主要來自于群體內(nèi)個體間。日本沼蝦UPGMA系統(tǒng)樹基本依據(jù)不同群體分別聚類，表現(xiàn)出一定的遺傳趨異

3、。結(jié)果表明：兩個地區(qū)日本沼蝦群體的遺傳多樣性處于較高水平：日本沼蝦江蘇地區(qū)長江和太湖兩個群體間存在一定的遺傳分化。
　　采用AFLP技術(shù)分別對太湖、長江日本沼蝦群體各30尾的基因組DNA進行了群體特異性位點比對分析，并對各位點基因頻率分布進行正態(tài)性檢驗、方差齊性檢驗(F檢驗)、樣本平均數(shù)差異顯著性檢驗(t檢驗)。結(jié)果顯示：3對引物共擴增出138個位點；太湖組是獨立于長江組的群體，而且它們是兩個分化了的野生群體；采用變異性的顯著性檢

4、驗(x2檢驗)對位點進行差異比較發(fā)現(xiàn)，23個位點在太湖組中出現(xiàn)的頻率顯著高于長江組，其中位點BY160、BY320、BY470、BY520是與太湖群體分化顯著關(guān)聯(lián)的位點，可作為區(qū)別太湖野生群體與長江野生群體的標記。
　　對我國江蘇省4水域日本沼蝦40個野生個體的線粒體細胞色素氧化酶亞基I(COI)部分序列進行了測定和分析。經(jīng)比對獲得640bp核苷酸片段，發(fā)現(xiàn)36個變異位點，得到19個單倍型，包括4個共享單倍型，各群體都具有較好的單