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文檔簡介
1、中華鱉(Trionyxsinensis)是我國重要的特種經(jīng)濟動物之一,其營養(yǎng)豐富,富含蛋白質(zhì)、鮮味氨基酸(谷氨酸和天門冬氨酸)、不飽和脂肪酸、鐵、鋅及鉻等多種礦物質(zhì)微量元素,近幾年其養(yǎng)殖業(yè)發(fā)展備受關注。目前,我國一些省市已相繼建立了中華鱉原種、良種場,啟動了中華鱉種質(zhì)資源的保護以及良種選育工作,但由于長達二十多年來的苗種盲目引進以及管理不善,致使中華鱉種質(zhì)資源存在一定程度上的混雜,中華鱉養(yǎng)殖業(yè)的發(fā)展受到了一定的限制。為保證中華鱉養(yǎng)殖業(yè)的
2、長遠發(fā)展,對各地區(qū)的鱉種遺傳多樣性進行檢測評價,為良種選育工作提供遺傳背景知識及理論參考,具有重要的意義。
本研究首次根據(jù)NCBI上提交的中華鱉線粒體DNA序列,設計了擴增進化速率較快的D-LOOP區(qū)(D環(huán))部分序列的引物,采用SSCP技術結合測序結果,探討中華鱉不同地理群體線粒體基因D-LOOP區(qū)變異度和遺傳多樣性。同時,本研究對日本群體♀×黃河群體()的雜交子代與親本子代之間的遺傳關系展開實驗,從分子水平探討了雜交對中
3、華鱉遺傳多樣性的影響。其研究結果如下:
(1)采用PCR結合DNA測序技術和SSCP技術,以日本群體、黃河群體、黃沙鱉群體3個中華鱉地理群體為實驗對象,結果顯示:在25個個體中,其堿基組成為A+T的平均含鼉(65.4%)高于G+C(34.6%),共檢測到變異位點7個(約占總位點數(shù)的5.7%),轉(zhuǎn)換/顛換值為2.76。3個地理群體核苷酸多樣性(x)為0.01995,平均核苷酸差異數(shù)(K)為2.453;單倍型多樣度最高的是日本
4、群體(0.80000),最低的是黃河群體(0.29487),核苷酸多樣性指數(shù)最高的是日本群體,為0.02219,最低的為黃河群體,為0.00709,日本群體的遺傳多樣性比黃河群體和黃沙鱉群體豐富。黃沙鱉群體與日本群體、黃河群體的遺傳距離較遠,分別為0.032和0.035。25個個體分屬6個單倍型,單倍型多樣度(Hd)為0.707,單倍型間的平均遺傳距離(P)為0.027;6個單倍型構建的UPGMA系統(tǒng)樹聚為3個分支。PCR-SSCP分析
5、,可以檢測到兩種類型的電泳圖譜,其中Ⅱ型均為日本群體。由上述結果可知,中華鱉群體mtDNAD環(huán)序列存在著較豐富的變異和遺傳多樣性。結合測序結果,推測PCR-SSCP技術可用于78位T→←A顛換變異位點的檢測。
(2)采用RAPD技術,以太湖群體為外群參照,對日本群體♀×黃河群體()的雜交子代進行遺傳多樣性分析。實驗從45個隨機引物中篩選出22個擴增較好的引物,在日本群體♀×黃河群體()的雜交子代、日本群體子代、黃河群體子代
6、和太湖群體4個群體中共擴增出176個位點,其中129條(73.30%)呈現(xiàn)多態(tài)性,平均每個引物擴增出了8條,擴增出的片段分子量在300-2500bp之間。多態(tài)位點比例、Nei基因多樣性指數(shù)以及Shannon信息指數(shù)大小順序為:雜交群體>日本群體>黃河群體>太湖群體,雜交子代比親本子代的的遺傳多樣性更豐富。4個群體兩兩之間的遺傳相似性指數(shù)在0.8351-0.9544之間,遺傳距離在0.0467-0.1802之間,雜交鱉子代與親本黃河群體子
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