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文檔簡介
1、目的:DEK是廣泛存在于細胞核內(nèi)高度保守的可磷酸化癌蛋白,在人類許多惡性腫瘤中均出現(xiàn)過表達,表現(xiàn)出與腫瘤的發(fā)生發(fā)展密切相關。DEK可通過改變?nèi)旧|(zhì)結(jié)構(gòu),修復DNA,參與mRNA剪接與信號通路,或作為轉(zhuǎn)錄因子等途徑調(diào)控細胞的增殖、分化、凋亡、遷移、衰老等,與腫瘤細胞的形成有著重要的關系。目前關于DEK促進腫瘤發(fā)展的研究越來越多,然而關于DEK與肺癌的關系以及DEK在肺癌中的作用機制尚未有完善的研究成果。前期研究結(jié)果顯示,DEK蛋白在人肺癌
2、腫瘤組織中的表達量明顯高于正常組織,提示DEK可能在肺癌的發(fā)病機制中發(fā)揮重要作用,因此本研究在前期工作的基礎上,進一步在細胞層面上研究DEK沉默對肺癌細胞轉(zhuǎn)錄組的影響,并深入探討DEK在肺癌中的作用機制,為肺癌的治療提供新的途徑與實驗依據(jù)。
方法:本實驗通過實時熒光定量RT-PCR與Western Blotting檢測6種肺癌細胞系中DEK表達水平差異,從中篩選出內(nèi)源性高水平表達DEK的細胞,并通過RNAi慢病毒載體構(gòu)建DEK
3、沉默的A549細胞,通過RNA-Seq檢測由DEK沉默誘導的差異表達基因,再通過GO分析與Pathway分析評估差異表達基因與肺癌的關系,最后在細胞層面上驗證分析的準確性,通過MTT法檢測DEK沉默對A549細胞增殖能力的影響,PI染色法檢測DEK沉默對A549細胞周期的影響,AnnexinⅤ-FITC/PI細胞凋亡檢測試劑盒檢測DEK沉默對A549細胞凋亡的影響,此外,通過實時熒光定量RT-PCR與Western Blotting檢測
4、IGFBP3/IGF-1R/AKT通路相關基因的表達水平。
結(jié)果:通過GO分析與Pathway分析評估DEK沉默的A549細胞中差異表達基因與肺癌的關系,結(jié)果顯示DEK與細胞生長和死亡密切相關。進一步,使用DEKsiRNA轉(zhuǎn)染A549細胞,檢測DEK沉默對A549細胞功能的影響,結(jié)果顯示DEK沉默可抑制A549細胞的增殖,引起A549細胞周期在G1期發(fā)生阻滯,而且能夠顯著促進細胞的凋亡。最后檢測IGFBP3/IGF-1R/AK
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