中國(guó)南方沿海3種經(jīng)濟(jì)鮑養(yǎng)殖群體遺傳多樣性分析.pdf_第1頁(yè)
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1、本文為評(píng)估三種經(jīng)濟(jì)鮑的遺傳變異現(xiàn)狀,利用RAPD分子標(biāo)記技術(shù)研究了福建(東山)、廣東(惠來(lái)、深圳、湛江)和海南(三亞)3省沿海五個(gè)九孔鮑養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu),利用微衛(wèi)星分子標(biāo)記技術(shù)研究了福建東山和廣東惠來(lái)養(yǎng)殖的皺紋盤鮑和盤鮑4個(gè)群體的遺傳多樣性。 九孔鮑的RAPD研究發(fā)現(xiàn),54個(gè)隨機(jī)引物中,22個(gè)引物擴(kuò)增穩(wěn)定用于統(tǒng)計(jì)分析。5個(gè)養(yǎng)殖群體172個(gè)個(gè)體中共產(chǎn)生180條大小在0.2~2.4kb之間的擴(kuò)增條帶,平均多態(tài)位點(diǎn)比例9

2、1.4%。湛江群體基因多樣性最高,為0.344,惠來(lái)群體最低,為0.259;群體基因多樣性的t檢驗(yàn)顯示,東山、深圳和三亞群體相互間平均基因多樣性差異并不顯著(P>0.05),而其他群體相互間差異顯著(P<0.01)。 五個(gè)養(yǎng)殖群體總體基因多樣性H<,T.、群體間平均基因多樣性H<,S>、群體間遺傳分化量D<,ST>和遺傳分化系數(shù)G<,ST>分別為0.381,0.313,0.068和0.179。G<,ST>介于0.076和0.24

3、6之間。分子方差分析(AMOVA)顯示,76.7%的遺傳變異來(lái)自于群體內(nèi)部個(gè)體間的差異,群體間的遺傳變異占總變異的23.3%。群體間F<,ST>為0.102~0.297,揭示了與G<,ST>相似的遺傳分化格局。UPGMA聚類分析顯示5個(gè)群體聚為2支,深圳、湛江與三亞群體聚為一支,東山和惠來(lái)群體聚為另一支。但AMOVA顯示,東山和惠來(lái)群體組與深圳、湛江和三亞群體組間遺傳分化并不顯著(F<,CT>=0.103,P=-0.099)。隨機(jī)組合檢

4、驗(yàn)表明,群體間呈顯著的遺傳分化狀態(tài),各地方群體應(yīng)分別作為單獨(dú)的“管理單元(management unit)”進(jìn)行遺傳資源管理,群體之間的移植應(yīng)嚴(yán)格監(jiān)管。 皺紋盤鮑和盤鮑的9對(duì)引物中,4對(duì)引物可同時(shí)在兩種鮑中穩(wěn)定擴(kuò)增。4個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)共檢測(cè)出24個(gè)等位基因;有效等位基因數(shù)為2.214~6.001,平均有效等位基因數(shù)為4.110;多態(tài)信息含量PIC值均在0.5以上,變化范圍為0.512~0.812;觀測(cè)雜合度介于0.382到0.677

5、之間,平均0.521;期望雜合度的變化范圍為0.550~0.836,平均0.705;各位點(diǎn)觀測(cè)雜合度均低于期望雜合度,雜合子偏離度D值均為負(fù)。4個(gè)養(yǎng)殖群體中,2個(gè)皺紋盤鮑養(yǎng)殖群體的等位基因數(shù)和有效等位基因數(shù)均大于2個(gè)盤鮑養(yǎng)殖群體;PIC值和期望雜合度排序均依次為:惠來(lái)盤鮑>惠來(lái)皺紋盤鮑>東山皺紋盤鮑>東山盤鮑。Hardy-Weinberg平衡的卡方檢驗(yàn)發(fā)現(xiàn),僅有東山皺紋盤鮑在位點(diǎn)Hdd108C、東山盤鮑和惠來(lái)盤鮑在位點(diǎn)Hdd115B符合

6、Hardy-Weinberg平衡。 4個(gè)位點(diǎn)平均近交系數(shù)為0.228。AMOVA表明,南方養(yǎng)殖的皺紋盤鮑和盤鮑95.22%的遺傳變異存在于群體內(nèi),群體間的遺傳變異僅為總遺傳變異的4.78%,但群體間的遺傳分化顯著(F<,SC>=0.048,P<0.001)。根據(jù)Nei(1972)的方法計(jì)算的群體之間的遺傳距離為0.084~0.186,惠來(lái)盤鮑群體與東山盤鮑之間的遺傳距離最小,東山盤鮑與東山皺紋盤鮑之間遺傳距離最大。UPGMA聚類分析表明

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