懷山藥微型塊莖誘導形成相關基因DoBBX6和DoBBX17的克隆、結構分析及遺傳轉化.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、懷山藥(Dioscorea opposita Thunb.)是我國著名的“四大懷藥”之一,藥食兼優(yōu)。為解析其微型塊莖誘導形成的分子機制,本研究以其優(yōu)良種質——鐵棍山藥為試材,在前期微型塊莖轉錄組分析研究的基礎上,對篩選到的微型塊莖誘導形成的潛在相關基因DoBBX6和DoBBX17進行克隆,并對其序列、蛋白結構及生化特性進行深入分析;為進一步研究基因的功能,分別構建了RNAi和過表達載體,并將過表達載體轉入馬鈴薯中。研究結果如下:

2、  1.DoBBX6和DoBBX17的克隆及序列分析
  采用RACE技術從微型塊莖中分離到了DoBBX6和DoBBX17基因cDNA全長。DoBBX6基因cDNA全長1332bp,開放閱讀框長1041bp,共編碼347個氨基酸,在N端有兩個串聯的B-box保守結構域,在C端有一個CCT結構域;DoBBX17基因cDNA全長為1811bp,開放閱讀框長1281bp,共編碼427個氨基酸,在N端含一個B-box保守結構域,在C端有一

3、個CCT結構域,這兩個基因編碼的氨基酸與其他植物具有較高的一致性,均屬于C2C2型鋅指蛋白基因。
  2.DoBBX6和DoBBX17蛋白結構分析
  DoBBX6和DoBBX17蛋白的初級結構均為酸性親水蛋白,二級結構均以無規(guī)則卷曲、α螺旋結構為主,兩者均不含跨膜區(qū)、信號肽,亞細胞定位預測均定位在細胞核中,且在C端CCT結構域中含有核定位相關的NLS序列。DoBBX6蛋白無序化的比例為22.5%,DoBBX17蛋白無序化比

4、例為45.4%,且CCT結構域均存在于蛋白的最大無序化區(qū)域內,DoBBX6和DoBBX17蛋白均存在多個潛在的磷酸化位點。這兩個鋅指蛋白作為核轉錄因子,利用生物信息學方法預測其主要在轉錄、轉錄調控、生長因子等方面發(fā)揮調控作用。
  3.DoBBX6和DoBBX17蛋白的生化特性分析
  采用瞬時轉化煙草的方法將DoBBX6、DoBBX17蛋白定位在細胞核中;通過酵母轉錄激活系統研究表明二者均具有轉錄激活活性,但其保守結構域B

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