早實枳和普通枳成花轉變過程中基因表達差異比較及成花關鍵基因PtFCA的調(diào)控機制研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、柑橘是世界第一大果樹。柑橘在生長發(fā)育過程中需經(jīng)歷2個重要的轉變時期:即童期向成年期的轉變和營養(yǎng)枝向結果枝的轉變。漫長的童期,極大的阻礙了柑橘育種進程和重要經(jīng)濟性狀遺傳規(guī)律的研究。目前關于植物成花調(diào)控的分子遺傳學研究結果大多數(shù)來自于模式植物,而對于多年生木本植物特別是果樹成花的調(diào)控機理知之甚少。早實枳與普通枳開花性狀存在較大差異,而遺傳背景相似,為柑橘成花發(fā)育的分子機理研究提供了寶貴的材料。本研究以普通枳和早實枳春梢為材料研究了二者在轉錄

2、組水平上的差異,并且對MPSS分析獲得的成花關鍵基因PtFCA進行了功能驗證及調(diào)控機理的研究。主要結果如下:
  1.MPSS比較了早實枳和普通枳春梢成花轉變時期轉錄組水平上的差異,在早實枳和普通枳中共檢測到了36,523條序列。在早實枳中存在6,859條特異序列,而普通枳有5,055條。同時發(fā)現(xiàn)有2,735個基因在早實枳和普通枳中存在差異表達。Real-time PCR驗證了MPSS檢測的30個差異表達基因的表達模式,其中28個

3、基因表達模式與測序結果一致,表明MPSS能準確檢測基因差異表達。
  2.對測序序列進行注釋,鑒定了569個轉錄因子,分布在60個基因家族中。早實枳和普通枳分別含有564和552個轉錄因子,其中屬于MADS基因家族最多,其次為AP2/EREBP和WRKY基因家族。同時發(fā)現(xiàn)了一些成花調(diào)控先相關的基因家族如MADS、SEP和MYB等。
  3.采用Blast2GO和KEGG對差異表達基因進行功能分類,GO分類發(fā)現(xiàn)差異表達基因具有

4、結合活性、酶活性及轉錄調(diào)控功能的最多。KEGG分析發(fā)現(xiàn)約200條代謝途徑參與早實枳和普通枳的成花轉變。
  4.本研究鑒定了枳中110條屬于擬南芥成花調(diào)控途徑的同源基因。比較成花調(diào)控基因在早實枳和普通枳的表達模式,發(fā)現(xiàn)大部分促進成花的基因在早實枳中上調(diào)表達,而抑制成花的基因則下調(diào)表達。
  5.分離了普通枳和早實枳的FCA同源基因(PtFCA)。普通枳和早實枳的PtFCA序列一致。PtFCA含有2個RRM、1個WW和1個Pr

5、oline-rich保守性結構域,與雙子葉植物FCA同源性較單子葉植物高。
  6.PtFCA具有選擇性剪切現(xiàn)象,共有3個轉錄本。PtFCA1編碼全長FCA蛋白。PtFCA2和PtFCA3編碼RRM2和WW結構域缺失的短截蛋白。FCA的選擇性剪切在枳和模式植物中既具有保守性又具有多樣性?;驑尳閷У难笫[表皮亞細胞定位結果表明,PtFCA1定位在細胞核中,具有轉錄因子特性。PtFCA2和PtFCA3則廣泛分布在細胞中,可能具有更為廣

6、泛的功能。
  7.Real-time PCR檢測PtFCA不同轉錄本在普通枳和早實枳不同發(fā)育階段和部位的表達模式,推測PtFCA可能與成花發(fā)育和根系發(fā)育相關。功能互補實驗證明PtFCA1能部分互補fca-1擬南芥突變體晚花表型。PtFCA2在fca-1擬南芥中異位表達后具有晚花及根系增長的表型,PtFCA3對成花時間和根系生長則沒有影響。表明PtFCA參與成花轉變和根系發(fā)育的調(diào)控,而不同轉錄本發(fā)揮的功能存在差異。
  8.

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