低氮脅迫下黃瓜幼苗差異表達基因鑒定與蛋白質(zhì)組學分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、黃瓜(Cucumis sativus L.)是世界上最重要的蔬菜作物之一。黃瓜栽培上需要施用大量的肥料,尤其是氮肥。氮肥是植物最重要的礦質(zhì)元素,它是氨基酸、蛋白質(zhì)、葉綠素、核酸、脂類以及其他重要代謝物質(zhì)的組成成分。氮素的缺乏會導致植物生長減慢,加速衰老,最終影響經(jīng)濟產(chǎn)量。然而,大量施用氮肥不僅增加的生產(chǎn)成本,還會導致果實硝酸鹽過量積累和產(chǎn)生土壤鹽漬化。減少肥料的投入的同時提高產(chǎn)品質(zhì)量而不影響產(chǎn)量是現(xiàn)代農(nóng)業(yè)面臨的主要挑戰(zhàn)。在前人的實驗結(jié)果

2、中,我們發(fā)現(xiàn)一些栽培品種對低氮脅迫有著較好的耐性。
   本研究選用前期試驗中鑒定出的耐低氮品種“津研四號”,通過其在轉(zhuǎn)錄水平及蛋白質(zhì)表達水平的差異,研究其在低氮脅迫條件下的應答機制,希望能為揭示黃瓜耐低氮脅迫的機理奠定基礎(chǔ)。
   為了鑒定黃瓜轉(zhuǎn)錄水平對低氮脅迫的應答,本試驗分別在正常營養(yǎng)條件以及低氮條件下栽培該黃瓜品種,并選取幼苗葉片進行轉(zhuǎn)錄水平的差異比較。通過Solexa測序技術(shù),本試驗鑒定出868個響應低氮脅迫的

3、基因,其中654個基因上調(diào)表達,214個基因下調(diào)表達,包括轉(zhuǎn)錄因子、酶基因以及與激素調(diào)節(jié)相關(guān)的基因等。本試驗選取了20個氮代謝相關(guān)或差異顯著的基因進行驗證,其中19個基因與表達譜測序結(jié)果一致,達到95%,證明表達譜測序結(jié)果準確可靠。為了進一步驗證測序結(jié)果的準確性,對RT-PCR驗證結(jié)果進行了qRT-PCR驗證,本試驗選取了已驗證的15差異基因進行進一步驗證,結(jié)果與RT-PCR結(jié)果完全一致,進一步證明了表達譜測序結(jié)果的可靠性。GO分析結(jié)果

4、顯示差異表達基因主要涉及“代謝過程”,“細胞”,“結(jié)合”,“細胞過程”,“細胞器”以及“催化活性”等。其中,在“含氮化合物代謝過程”中含有62個差異表達基因,其中44個基因上調(diào)表達,18個基因下調(diào)表達。本試驗同時鑒定出了一些富集的Pathway,例如光合作用捕光蛋白質(zhì),苯基丙酸類合成,類黃酮的生物合成、氮代謝、光合作用以及苯丙氨酸代謝等途徑。
   為了鑒定低氮脅迫下黃瓜幼苗蛋白質(zhì)水平的變化差異,本試驗選取與Solexa測序相同

5、的材料進行蛋白質(zhì)雙向電泳分析。用24cm,pH4-7的IPG膠條進行試驗,每根膠條上樣量為1mg,用12.5%的分離膠進行雙向電泳。對照與低氮處理各進行三次重復試驗,經(jīng)過考馬斯亮藍染色后的膠,用掃描儀在300dpi分辨率采集圖像。用Imagemaster2D Platinum7.0圖像分析軟件處理圖像,分析差異表達的蛋白質(zhì)點,并進行質(zhì)譜檢測。結(jié)果表明:在低氮脅迫處理下,表達出現(xiàn)明顯差異的蛋白質(zhì)點共有7個。通過質(zhì)譜分析,對這7個蛋白質(zhì)進行

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