煙草打頂前后根尖組織SSH-cDNA文庫的構建與分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、煙堿是煙草特有的生物堿,是煙草根系合成的次生代謝產物。煙堿自精氨酸或鳥氨酸途徑形成吡咯環(huán),自天冬氨酸途徑形成嘧啶環(huán),最終兩環(huán)縮合形成煙堿的生物合成途徑己被研究的相當清楚。打頂以后,煙株體內煙堿含量大量積累,然而對造成煙株體內煙堿含量升高的因為以及煙堿合成的調節(jié)機制并不清楚。生物堿生物合成的可誘導性特點表明,生物堿合成過程必定是信號轉導的結果,盡管已有很多生物堿合成的關鍵基因被克隆,可被證實的參與生物堿合成的調控基因卻很少。因此,用抑制性

2、消減雜交的方法構建打頂前后的SSH—cONh文庫,篩選差異表達的基因,為揭示打頂對煙堿含量影響的分子基礎具有很大的潛力。
   本研究~K326為材料進行打頂24h處理,打頂煙株為實驗組(tester),不打頂煙株為對照組(driver)和不打頂煙株為實驗組(tester),打頂煙株為對照組(driver),采用高靈敏度和高產出率的抑制差減雜交(SSH)技術構建煙草打頂前后根尖組織的SSH—cDNA文庫,得到兩個各含1000個克

3、隆的正反向消減文庫。通過篩選文庫獲得陽性克隆進行測序,利用生物信息學的方法進行分析,以期從基因組水平探討煙堿生物合成的分子機理。主要研究結果為:
   (1)應用SSH技術成功構建了煙草打頂前后根尖組織的cDNA文庫,克隆轉化后經菌液PCR擴增分析發(fā)現cDNA插入片段大小主要分布在200—700bp之間,符合實驗預期要求,為高效篩選差異表達基因奠定了基礎。
   (2)利用反向Nor‘thern雜交對經菌落PCR初步驗證

4、得到的1300個克隆進行篩選,從中篩選到450個雜交信號差異明顯的克隆,進行測序,將測序結果進行ESTs生物信息學分析,發(fā)現了一些參與調控煙堿合成的基因和轉錄因子,利用半定量RT—PCR驗證3個EST序列(PMT、ODC、gABS-box)表達模式,發(fā)現在打頂后這3個EST序列的表達量增強。
   (3)將獲得的非冗余EST序列進行功能注釋,發(fā)現我們克隆的很多基因參與植物體內的代謝活動,如植物激素的合成、植物的次生代謝過程等,這

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