甘藍EST-SSR標記開發(fā)及應用.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、結球甘藍(Brassica oleracea var.capitata L.)(以下簡稱甘藍)是十分重要的十字花科蕓薹屬蔬菜作物,在我國蔬菜周年供應和出口貿(mào)易中處于重要地位。隨著分子生物學的快速發(fā)展,分子標記技術在遺傳圖譜繪制、重要農(nóng)藝性狀基因定位、生物遺傳多樣性分析、遺傳進化分析、品種鑒定等方面得到廣泛應用。其中,簡單重復序列(Simple sequence repeat,SSR)標記技術因多態(tài)性高,易檢測,共顯性和特異性明顯等特點應

2、用更加普遍。鑒于已公開報道可用的甘藍SSR標記數(shù)量較少,本研究基于NCBI數(shù)據(jù)庫公開報道的62,576條與甘藍相關的EST,研究開發(fā)了EST-SSR標記,并將其應用于甘藍指紋圖譜構建、雜交種純度鑒定、與甘藍顯性雄性不育基因連鎖的分子標記等。主要研究結果如下:
   1、甘藍EST-SSR特征及擴增分析。利用SSRIT在線分析軟件(http://www.gramene.org/db/searches/ssrtool)對19,611

3、條無冗余甘藍EST進行了搜索,共得到1,219條SSR,分布在1,176條EST上,分布密度為1/11.48kb,包括273種重復基元。其中,二核苷酸(353個SSR)和三核苷酸(423個SSR)占主導地位;出現(xiàn)最多的重復基元是AG/CT,占總數(shù)的25.59%,其次為AAG/CTT占7.71%;其它重復類型所占比例均不足5%?;?,176條含有SSR的EST,設計合成了978對甘藍EST-SSR引物。以早熟圓球型甘藍397和晚熟扁圓球

4、型甘藍20-2-5兩份自交系為試材,對合成引物進行初步的擴增分析,其中897對引物有擴增產(chǎn)物,共擴增出1,026條擴增帶;128對引物在兩份材料間表現(xiàn)出多態(tài)性,共擴增258條多態(tài)性帶(占總帶數(shù)的25.15%)。表明開發(fā)的EST-SSR引物在甘藍上有較好的可用性。
   2、構建了部分甘藍品種的指紋圖譜并進行“京豐1號”的純度鑒定。在對甘藍EST-SSR初步擴增分析的基礎上,利用BoE002、BoE222、BoE225和BoE91

5、6等4對引物構建了“中甘11”、“8398”、“中甘15”和“中甘21”等4個春甘藍及其親本的EST-SSR指紋圖譜;利用BoE974、BoE916、BoE337、BoE316和BoE222等5對引物構建了“京豐1號”、“晚豐”、“中甘8號”、“中甘18”、“中甘19”和“中甘22”等6個秋甘藍及其親本的EST-SSR指紋圖譜。利用能夠擴增出互補帶型的標記BoE222進行“京豐1號”雜交種的分子鑒定,種子純度鑒定為90%,與田間鑒定結果

6、吻合率約為98%。
   3、獲得了與早熟圓球型甘藍顯性雄性不育基因CDMs399-3連鎖的分子標記。以來自早熟圓球甘藍397育性分離群體的5株可育株及4株純合不育株分別構建可育池和不育池,并以該群體的敏感不育單株自交得到的73株F2分離群體的植株為試材,篩選與早熟圓球甘藍顯性雄性不育基因連鎖的標記,結果得到共顯性標記BoE332(不育片段約270bp,可育片段約290bp),該標記與顯性雄性不育基因CDMs399-3連鎖距離為

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